卡开发发 发表于 2019-11-15 19:16 明白了 谢谢老师  |
gch123 发表于 2019-11-15 19:10 那样拿到的只是约束条件下的极小点，说不定是鞍点或其他的，要让这个结构和其他无约束极小具备同样的物理意义不现实。 |
卡开发发 发表于 2019-11-15 18:58 谢谢老师，那如果固定x和y，只让吸附原子在z方向动，这样可行吗？ |
gch123 发表于 2019-11-15 13:09 如果优化到其他位置说明这个位置并不在势能面的极小点上，没必要讨论的话就不用把他算出来，有些吸附构型确实可能做不出来。审稿人问的话你就可以老老实实说bridge位试着做过，调整了几次结构之后还是被优化到其他结构了。 |
卡开发发 发表于 2019-11-3 19:58 老师，再请教一下，当计算原子在石墨烯的bridge位点上的吸附时需不需要固定吸附原子的x和y坐标？如果不固定，这样的吸附结果会不会与top位或者六圆环中心位点的吸附结果一样？ |
lao7 发表于 2019-11-3 18:42 哦哦  |
卡开发发 发表于 2019-11-3 19:58 懂了 谢谢老师 |
gch123 发表于 2019-10-28 20:49 我不知道你具体的意思，你的意思是原子放到边界上和放到中间吸附相同吗？如果是这个问题，那么因为周期性，这两个原子是同一个原子，只是不同程序显示模式不同所以你能看到两个，有些程序或显示模式你就只能看到一个。 如果你指的是，想要做一个模型来表示某个表面真实的边缘，这种情况要么选择台阶表面来模拟，要么就是做一个带状的模型。 |
gch123 发表于 2019-11-3 10:24 要考虑真实情况！在一个体系下，更多时候暴露的是面。如果边角暴露面比例很低，该位点即使结合能很高，也不具有实际意义。 |
lao7 发表于 2019-10-30 12:38 就是计算吸附的时候，吸附位点可以选在边界上吗？  |
gch123 发表于 2019-10-28 20:49 看不懂你在说什么？晶体吗？算一边不就行了？另外一面不是周期性或者对称性嘛？ |
lao7 发表于 2019-10-28 11:01 谢谢老师的解答，我还有一个问题，就是想在位于边界的原子上吸附一个原子，但加上吸附原子后会在另外的边界上也出现这个原子（因为周期性），这样会不会对结果有影响？在两个界面上出现的吸附原子是属于同一个原子吗？ |
lao7 发表于 2019-10-28 11:01 就是这样也不能保证一定落到最优势的极小点。2L说的靠谱 |
| 成键位置的1.5至2倍，大约Gview的长度大约1.6-2.2左右。尽量远点。如果太近，给可能的自由移动造成了麻烦！ |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-16 04:29 , Processed in 0.163935 second(s), 25 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites