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VMD做电子激发过程中空穴和电子的等值面分子被遮挡

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发布时间: 2019-11-13 16:54

正文摘要:

Sobereva老师,我在给分子做electron和hole的等值面图形显示的时候 ,分子来回被线条遮挡,虽然等值面也显示,只有转动到一定的角度分子中的等值面的图才可以看见,线条面怎样去除呢?有没小伙伴遇到我这样的问题的 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2019-11-15 00:29:33
艾笑 发表于 2019-11-14 14:21
谢谢老师的帮助,已经把这个问题处理好了,在用Multiwfn选择2 Local term only形成cube文件,分子就没有 ...

注意这样得到的是不严格的
艾笑 发表于 Post on 2019-11-14 14:21:48
sobereva 发表于 2019-11-13 22:26
你先在Multiwfn里直接看等值面,如果看到的正常,就是VMD的问题。

如果在Multiwfn里直接看到的等值面 ...

谢谢老师的帮助,已经把这个问题处理好了,在用Multiwfn选择2 Local term only形成cube文件,分子就没有外边的边框啦!开熏~~~
sobereva 发表于 Post on 2019-11-13 22:26:21
艾笑 发表于 2019-11-13 22:02
收到 老师 不好意思 我没有注意到群规,老师我处理的时候 发现hole的等值面显示是没有问题的,只有electr ...

你先在Multiwfn里直接看等值面,如果看到的正常,就是VMD的问题。

如果在Multiwfn里直接看到的等值面也是类似异常的,把给Multiwfn用的Gaussian输出文件、fch文件都压缩后上传(如果超过5MB,用网盘),我看看到底是程序产生的格点数据问题还是什么其它情况,并且把你在Multiwfn里输入的命令都告诉我。

艾笑 发表于 Post on 2019-11-13 22:02:04
sobereva 发表于 2019-11-13 17:45
不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题,注意看群文件里群规,以及论坛置顶的计算化学公社论坛新 ...

收到 老师 不好意思 我没有注意到群规,老师我处理的时候 发现hole的等值面显示是没有问题的,只有electron的时候会出现这种问题,我不清楚这是什么原因,查看 showcub.vmd中的两个 filename1.cub没有差别,就是找不到原因,为什么electron的显示有问题
sobereva 发表于 Post on 2019-11-13 17:45:59
不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题,注意看群文件里群规,以及论坛置顶的计算化学公社论坛新人必读。


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