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请问如何实现构建如图核酸—polymer系统?

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发布时间: 2019-11-18 17:46

正文摘要:

大家好,我是刚接触amber的小白,在文献(https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0186816)中看到构建核酸—阳离子聚合物系统的模拟,想要尝试做一下,一直没有弄明白核酸和聚合物是如 ...

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懒蛋蛋 发表于 Post on 2019-11-21 14:48:39
sobereva 发表于 2019-11-20 02:26
把聚合物、蛋白质各自的结构都准备好,手动合并成一个文件,在VMD里的VMD Main窗口里用mouse - move - mole ...

非常感谢!
sobereva 发表于 Post on 2019-11-20 02:26:30
把聚合物、蛋白质各自的结构都准备好,手动合并成一个文件,在VMD里的VMD Main窗口里用mouse - move - molecule拖动蛋白质或聚合物到合适的相对位置,最后保存成新的结构文件就完了
没必要非得刻意强调30埃处,只要距离别太近导致有位阻作用,并且二者挨在一起就可以

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