求助关于charmm力场中br的力场的选取

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发布时间: 2019-12-16 20:43

本帖最后由 shenq 于 2019-12-17 09:42 编辑各位老师，我在做表面活性剂的模拟。查文献后[张岩, 祝新哲, 孟琪, et al. 分子模拟十六烷基三甲基溴化铵对石油污染物在粗糙石英砂表面脱附的影响[J]. 化工进展, 2018 ...

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fhh2626 发表于 Post on 2019-12-17 10:44:38

shenq 发表于 2019-12-17 09:39
感谢sobereva老师！
图片已修正。
那么也是说在矿物+ctma这种情况下，使用clayff+oplsaa力场比使用claf ...

矿物的话有近年来发表的INTERFACE力场

Br离子用* J. Chem. Theory Comput., 2015, 11 (4), pp 1645–1657就挺好

shenq 发表于 Post on 2019-12-17 09:39:09

本帖最后由 shenq 于 2019-12-17 09:43 编辑

sobereva 发表于 2019-12-16 22:49
贴图方式不对，看不到你的图，注意修改。传图的方法看置顶的新社员必读贴

CHARMM没有适合Br离子的，你提 ...

感谢sobereva老师！
图片已修正。
那么也是说在矿物+ctma这种情况下，使用clayff+oplsaa力场比使用claff+charmm36力场更算一个正确的选择？

sobereva 发表于 Post on 2019-12-16 22:49:51

贴图方式不对，看不到你的图，注意修改。传图的方法看置顶的新社员必读贴

CHARMM没有适合Br离子的，你提到的那个几个都是共价键相连的Br。可以用OPLS-AA，溴离子用opls_402描述

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