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ORCA安装后运行出错,请大神帮忙看下什么问题,实在搞不定

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发布时间: 2020-1-3 16:28

正文摘要:

这台机子有intel的编译器,但是我用的是gcc g++ gfotran 出错信息如下: which openmpi信息: [feng@codes test]$ which openmpi /usr/bin/which: no openmpi in (/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin ...

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wzkchem5 发表于 Post on 2022-6-29 22:12:04
waker 发表于 2022-6-29 14:52
你好,我发现我遇到和你一样的问题了,请问一下你的问题解决了吗?另外我是电脑小白,能私信和我说说在wi ...

你的windows系统上安装过intel编译器或者intel mpi吗?如果没安装过,那就不存在注释掉intel信息的问题
waker 发表于 Post on 2022-6-29 21:52:50
noraa 发表于 2020-1-20 23:30
折腾了很久,自己找到原因了,写在帖子里面供大家参考:
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突 ...

你好,我发现我遇到和你一样的问题了,请问一下你的问题解决了吗?另外我是电脑小白,能私信和我说说在window系统下,如何在环境变量设置中注释掉intel的信息吗?
abin 发表于 Post on 2020-1-22 21:42:29
Create two scripts.

script_A, for orca.
#!/bin/bash
### something to set the proper openMPI and PATH for orca.
XXXXXX
# command to invoke orca run
XXXXXX

script_B, for vasp
#!/bin/bash
## you may need to set the Intel for VASP
XXXXXXX

### you may need to set PATH for vasp

### write code here to invoke vasp run.

No need to set openMPI or Intel in your ~/.bashrc file.

Create folder_A for orca, copy script_A and your input files to folder_A.
Edit script_A if needed.
bash script_A &
If there is something like PBS, then incorporate script_A to the pbs or slurm script.

Same story for your VASP and script_B.

Any way, please forgive your Windows logic when you are going to try something on Linux platform.

Good luck.



biogon 发表于 Post on 2020-1-21 20:20:18
noraa 发表于 2020-1-20 23:30
折腾了很久,自己找到原因了,写在帖子里面供大家参考:
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突 ...

用两个用户名跑就行了,两个不同的bashrc
noraa 发表于 Post on 2020-1-20 23:30:17
本帖最后由 noraa 于 2020-1-20 23:32 编辑

折腾了很久,自己找到原因了,写在帖子里面供大家参考:
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突引起的,在/etc/profile 或者用户的.bashrc中注释掉Intel的相关信息后运行无误。
2、我这里也尝试安装了vasp,用的是社长的方法。这个时候orca和vasp只能运行其中一个,即在环境变量设置中注释掉intel的信息,然后运行orca;添加intel的信息,orca死掉,vasp可以运行。很不爽呀,怎么办呢?运行的vasp的时候source一下就可以了,其他的按照orca的要求来,这样稍微麻烦一点,但是不用频繁的改动.bashrc。保证了需要的时候,可以快速的运行其中一个程序。
3、怎么才能使orca和vasp同时运行呢?不要使用intel的编译器和intelmpi?还是有共存的方法?
sobereva 发表于 Post on 2020-1-3 17:33:56
运行which openmpi毫无意义,本来就没有叫openmpi的命令

确保openmpi编译正常,并且用的是当前ORCA兼容的版本。说不清楚就上传输出文件

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