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请问势能面上应该放最稳定构象吗,还是需要扫描单键旋转的垒具体分析呢?

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pet
发布时间: 2020-1-8 16:47

正文摘要:

最近在计算一个不饱和醇类与OH的反应,采用的优化方法基组是M062X/def2tzvp,在计算的过程中有以下疑问:1.在势能面上是应该全放最低构象(例如通过转动单键使其形成氢键等),还是应该直接放羟基直接进攻初始反应物 ...

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pet 发表于 Post on 2020-1-28 18:59:47
求助!
sobereva 发表于 Post on 2020-1-8 21:13:08
没有具体结构不好说

有的体系某些区域构象不同虽然会造成体系能量不同,但对于计算你感兴趣的区域的反应可能没有直接关系,几乎不影响反应区域的结构也不影响反应势垒,这种情况那些区域构象不用那么讲究。但如果没有任何前提,一般还是先用molclus构象搜索找能量最低构象。

另外,能量最低构象状态发生反应的势垒也可能比起能量更高构象发生反应势垒更高,此时往往拿后者讨论反应更有意义。

总之都得结合具体体系才能说。

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