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VASP5.4.4/内存报错+VASPKIT+CentOS7下装Materials Studio 8.0

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发布时间: 2020-1-13 21:51

正文摘要:

本帖最后由 wypkdhd 于 2023-4-26 22:47 编辑 2020.2.16更新关于各种报错,内存溢出报错(任务跑了一段时间自动停止)等一些列有关mpi不兼容的问题。更新提任务后后台任务stopped的问题。 2020.4.26针对目前的 ...

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wypkdhd 发表于 Post on 2024-11-4 10:43:47
后到咸阳斯蒂庞 发表于 2024-10-31 20:49
楼主您好,我在将2019的mpi换为2015的mpi时遇到了以下问题,,在mpi安装过程当中并无报错,5.4.4版本可以正 ...

兄弟,我记得vasp6对mpi版本有最低要求。。。不行您老老实实用oneapi吧,那个一点问题没有,用oneapi2023年版本即可。

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后到咸阳斯蒂庞 + 5 按照楼主的方法已经成功解决了,在此感谢!

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后到咸阳斯蒂庞 发表于 Post on 2024-10-31 20:49:14
本帖最后由 后到咸阳斯蒂庞 于 2024-11-1 14:29 编辑

楼主您好,我在将2019的mpi换为2015的mpi时遇到了以下问题,,在mpi安装过程当中并无报错,5.4.4版本可以正常运行,但当运行vasp.6.3.2时会出现:vasp_cellopt: symbol lookup error: vasp_cellopt: undefined symbol: mpi_f08_compile_constants_mp_mpi_info_null_的报错。想请教一下各位这个问题该如何解决。
wypkdhd 发表于 Post on 2024-10-22 11:15:37
Qingming 发表于 2024-9-29 18:27
老师您好,我先前用的oneapi编译的vasp,现在用您的方法安装mpi2015,安装后运行vasp报错vasp: error while  ...

输入which mpiexec 显示啥?我这边已经毕业,有情况首页有群,群里艾特。
Qingming 发表于 Post on 2024-9-29 18:27:08
老师您好,我先前用的oneapi编译的vasp,现在用您的方法安装mpi2015,安装后运行vasp报错vasp: error while loading shared libraries: libmkl_intel_lp64.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory。请问是怎么回事,应该怎么解决啊?谢谢老师
Wuwei 发表于 Post on 2024-6-1 19:45:02
本帖最后由 Wuwei 于 2024-6-11 23:05 编辑

【已经解决,仅供参考】
在安装intel mpi 2015的时候,出现下边的情况
Please type the full path to the installation:/opt/intel

Select the target software(s) which you will install
1.intel-2015.2.164
2.intelmpi-5.0.2.044
3.ALL
Enter your selection:2
[ww] Info: Installing IntelMPI (with intel), please wait a minute ...
Intel does not installed, please install Intel Compiler firstly!
有大佬知道这是啥情况吗?

以下步骤可能有无效的内容,仅供参考
通过重装之后能够找到编译器
    sudo apt-get update
    sudo apt-get install --reinstall libc6 libc6-dev

~/.bashrc中加入以下环境配置
    source /opt/intel/oneapi/compiler/2021.4.0/env/vars.sh
    source ~/.bashrc
删除/opt/intel/mpi/下之前关于intelmpi-5.0.2.004的文件夹(我的主机中,该目录下只有一个文件夹)
重新运行./hpcsoft




Wuwei 发表于 Post on 2024-5-30 21:25:20
本帖最后由 Wuwei 于 2024-5-30 21:26 编辑
_Fun 发表于 2024-5-20 15:15
老师你好,在编译vasp5.4.4的时候出现了如下错误:
make[3]: Entering directory `/home/CMX/vasp.5.4.4/b ...

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 23583&fromuid=49424看下这个? 我遇到相同的问题,通过3楼的回答解决了
_Fun 发表于 Post on 2024-5-20 15:15:24
老师你好,在编译vasp5.4.4的时候出现了如下错误:
make[3]: Entering directory `/home/CMX/vasp.5.4.4/build/std/lib'
fpp -f_com=no -free -w0 preclib.F preclib.f90
make[3]: fpp: Command not found
make[3]: *** [preclib.f90] Error 127
make[3]: Leaving directory `/home/CMX/vasp.5.4.4/build/std/lib'
make[2]: *** [all] Error 2
make[2]: Leaving directory `/home/CMX/vasp.5.4.4/build/std/lib'
make[1]: *** [lib] Error 2
make[1]: Leaving directory `/home/CMX/vasp.5.4.4/build/std'
make: *** [std] Error 2
还请老师指导下
处理器AMD,centos7系统,编译器Intel Parallel Studio XE 2019
wypkdhd 发表于 Post on 2024-4-25 16:01:59
qzm 发表于 2024-4-6 12:10
老师,按照您这个教程,我已经完美编译vasp了,非常感谢,请问出个编译安装CP2K的教程吗

不过cp2k可以参考论坛内刘锦程老师的帖子,甚至cp2k官网给的都很详细。
wypkdhd 发表于 Post on 2024-4-25 15:41:14
qzm 发表于 2024-4-6 12:10
老师,按照您这个教程,我已经完美编译vasp了,非常感谢,请问出个编译安装CP2K的教程吗

我已毕业。
qzm 发表于 Post on 2024-4-6 12:10:36
老师,按照您这个教程,我已经完美编译vasp了,非常感谢,请问出个编译安装CP2K的教程吗
wypkdhd 发表于 Post on 2024-3-11 07:56:57
Prof.Huang 发表于 2024-3-9 21:39
您好,老师请问如果用的intel oneapi 编译5.4.4该怎么操作,安装包里面安装第二个安装不上

oneapi 2023在5.4.4上好像不存在内存溢出操作啊,如果你是单纯要编译5.4.4,直接参考知乎有个帖子,就是opeapi安装vasp,5.4.4和vasp6安装差不多。
Prof.Huang 发表于 Post on 2024-3-9 21:39:25
您好,老师请问如果用的intel oneapi 编译5.4.4该怎么操作,安装包里面安装第二个安装不上
zzffzz33 发表于 Post on 2023-11-10 10:27:38
wypkdhd 发表于 2023-11-10 09:17
你确定你是root账户吧,不是root账户安装方法要看那章节非root安装的。

root账号,好的谢谢老师,我自己再试试
wypkdhd 发表于 Post on 2023-11-10 09:17:19
zzffzz33 发表于 2023-11-9 20:08
感谢老师的回复,就是我bashrc里更改之后如下:
source /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144 ...

你确定你是root账户吧,不是root账户安装方法要看那章节非root安装的。
wypkdhd 发表于 Post on 2023-11-10 09:15:56
zzffzz33 发表于 2023-11-9 20:08
感谢老师的回复,就是我bashrc里更改之后如下:
source /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144 ...

你去这个source /opt/intel/profile.d/mpi_intelmpi-5.0.2.044.sh intel64文件夹下看看你的东西在不在。按理说,你bashrc搞完之后,如果2015的文件存在,重新source一下就可以了。

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