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Gaussview创建的键parmchk2命令不识别

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发布时间: 2020-3-6 13:09

正文摘要:

为了得到Amber的参数文件和坐标文件,我使用了Gaussview创建了小分子的结构,如下图所示,并保存为Lig.mol2文件。使用[size=1em]parmchk2 -i Lig.mol2 -f mol2 -o Lig.frcmod[size=1em]命令时,出现了错误,如下图所 ...

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juddtrump 发表于 Post on 2020-12-14 11:02:01
hddonghao 发表于 2020-3-6 16:03
非常感谢,使用后没有再报错,真的谢谢你。但是后面我使用sleap -f leap.in命令时,出现了
Checking cha ...

您好!请问这个问题解决了吗?我也遇到类似的情况?请问怎么解决了。还请前辈指导一下,谢谢!
hddonghao 发表于 Post on 2020-3-6 16:03:01
snljty 发表于 2020-3-6 13:17
mol2里面Ar改成ar试试。

非常感谢,使用后没有再报错,真的谢谢你。但是后面我使用sleap -f leap.in命令时,出现了
Checking charge:
Warning: non-integral total charge: -16.873
assertion "element != 0" failed: file "pertab.cpp", line 177, function: static const char* mort::pertab_t::get_symbol(size_t)
      1 [main] sleap 34684 cygwin_exception::open_stackdumpfile: Dumping stack trace to sleap.exe.stackdump
这是什么原因呢?该如何解决啊?恳请大神指教。
snljty 发表于 Post on 2020-3-6 13:17:21
mol2里面Ar改成ar试试。

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