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能垒计算时是否需要加弥散函数

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wwp
发布时间: 2020-3-7 18:59

正文摘要:

如老师所说的:一种粗略但比较省事的计算溶剂下焓或自由能的方法如下: (1)用opt freq优化结构同时获得焓或自由能的热校正量(获得焓的热校正量时建议用ZPE校正因子)。溶剂模型是否需要用看情况 (2)在(1)的结构下 ...

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wwp 发表于 Post on 2020-3-8 12:47:59
liyuanhe211 发表于 2020-3-8 12:19
高精度单点要给负电荷集中的原子带弥散。优化不带弥散通常没有大问题,但是如果你已经知道加、不加弥散对 ...

好的李老师,我看看哪里出现了问题。那对于自由能热校正量来说不带弥散也是可以的吗?
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-8 12:19:23
wwp 发表于 2020-3-8 07:54
李老师 我还想请问一下:就按着上面的那个阴离子体系我能否利用在b3lyp-d3(bj)/6-311g**优化后得到的自 ...

高精度单点要给负电荷集中的原子带弥散。优化不带弥散通常没有大问题,但是如果你已经知道加、不加弥散对优化结果有显著影响,就应该搞清楚这个影响是怎么回事儿。
wwp 发表于 Post on 2020-3-8 07:54:29
liyuanhe211 发表于 2020-3-8 02:34
这里一般指电子能。当然加了热力学量完了之后电子能的改变也还在里头。

李老师 我还想请问一下:就按着上面的那个阴离子体系我能否利用在b3lyp-d3(bj)/6-311g**优化后得到的自由能热校正量+在高精度下得到的单点能,来作为体系的自由能呢?谢谢老师了。
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-8 02:34:06
wwp 发表于 2020-3-7 20:46
李老师我在一篇帖子看到:
• 加弥散对改进结果有益,计算条件允许可以加弥散:
计算反应势垒

这里一般指电子能。当然加了热力学量完了之后电子能的改变也还在里头。
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-8 02:33:14
wwp 发表于 2020-3-7 20:39
李老师在没加弥散下 -OOH中的氢与氧相连接;加了弥散后-OOH中的氢却跑到了氮上面去,氮是负一价氮

键连方式都不一样了,显然不是常规意义上的“弥散有助于改善势垒”的范畴,那是描述同一个过程时的比较。直观上这似乎更多的是优化算法的事情。虽然质子化在氮上而不是过氧醇上确实从直观上更稳定,但不至于N为负离子、过氧醇中性的极小点就不存在。可以尝试优化的时候把步长减小,并且调整初猜的二面角不要让O-H和C=N在同一侧
wwp 发表于 Post on 2020-3-7 20:46:50
wwp 发表于 2020-3-7 20:39
李老师在没加弥散下 -OOH中的氢与氧相连接;加了弥散后-OOH中的氢却跑到了氮上面去,氮是负一价氮

李老师我在一篇帖子看到:
• 加弥散对改进结果有益,计算条件允许可以加弥散:
计算反应势垒
优化阴离子体系或弱相互作用体系的结构、对其进行振动分析

里面的计算反应势垒是指哪些方面呐?包括那些自由能热校正的结果吗?
wwp 发表于 Post on 2020-3-7 20:39:19
liyuanhe211 发表于 2020-3-7 19:52
对“负电荷比较多的”原子加弥散。
如果没有计算错误,以加了弥散的为准
但是你说“加/不加弥散,优化的 ...

李老师在没加弥散下 -OOH中的氢与氧相连接;加了弥散后-OOH中的氢却跑到了氮上面去,氮是负一价氮
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-7 19:52:39
对“负电荷比较多的”原子加弥散。
如果没有计算错误,以加了弥散的为准
但是你说“加/不加弥散,优化的结果差别巨大”仍然听起来不正常。怎么个巨大法

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