构造的模型或者LAMMPS输出的的轨迹文件中同一个分子之间的键没有显示应该怎样处理呢

正文摘要:

我用一个原子来代替一个基团建立单个分子模型，（下面的一个原子代表一个甲基或其他基团）  但是在用packmol建立好整个模型后可视化结果是单个原子  dump轨迹文件也是这样，想问这种建立联合原 ...