老师，请问如果有一个过渡金属配合物A-B-A，过渡金属中心B和两个不相连的相同配体A。是应该定义三个片段，计算E_all(A-B-A）- E_all(A）- E_all(B）- E_all(A），还是把两个配体A当作一个片段，计算E_all(A-B-A）- E_all(A-A）- E_all(B）呢。如果定义三个片段，Multiwfn是不是暂时不支持，我可以先定义两个片段，再仿照前面写一个第三个片段的$new_job。

sobereva 发表于 2025-6-21 04:20
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不好意思sob老师，我眼瞎了

0608llt 发表于 2025-6-20 14:21
文中写的文件包在哪啊

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文中写的文件包在哪啊

wzkchem5 发表于 2024-4-10 21:52
报错信息说得那么清楚，potentially linear dependencies in the auxiliary basis
别只去搜那行ORCA fin ...

好的老师，感谢您讲的这么清楚，我再弄一下

ligninpyrolysis 发表于 2024-4-10 09:10
sob老师好，我按照这个教程在课题组的集群上计算结合能，①先算了氯化胆碱和乳酸结合的结合能，使用8核每个 ...

报错信息说得那么清楚，potentially linear dependencies in the auxiliary basis
别只去搜那行ORCA finished by error termination in GTOInt。如果只有“ORCA finished by error termination in GTOInt”，之前没有其他的报错信息，那倒还有比较大概率是并行的问题。
做计算最忌讳的就是不经理解报错信息的内容，直接去搜之前有没有人遇到过相同的报错。看到报错信息，第一要想的应该是正确判断哪几行是报错信息，不遗漏任何可能是报错信息的话；第二，对报错信息做英语阅读理解，把报错信息的意思读懂。比如这里你就应该看到potentially linear dependencies in the auxiliary basis是说辅助基组可能有线性相关，此时你就应该在orca手册里搜linear dependency，会发现主要在两个地方出现，一个是讲轨道基线性相关的，用sthresh解决；一个是讲辅助基线性相关的，用PGC解决

sob老师好，我按照这个教程在课题组的集群上计算结合能，①先算了氯化胆碱和乳酸结合的结合能，使用8核每个5000MB计算的，成功了，得到了5个能量。但是在算②两个我的木质素模型化合物的结合能时，出现了如下图的错误，这个是因为什么原因造成的呢？




我查了下可能是并行计算时出的问题，然后就改为先用1个核1000MB看一下，还是报错了，显示如下

sobereva 发表于 2020-5-23 06:05
在本文末尾增加了自动批量计算和输出结合能的脚本

社长，把这个功能加一个可以定义计算多个片段的功能

在本文末尾增加了自动批量计算和输出结合能的脚本