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如何考察一个分子结构中两个片段之间的pai轨道重叠程度?

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发布时间: 2020-3-14 09:49

正文摘要:

老师您好,我想要考察一个分子结构中两个片段之间的pai轨道重叠程度,看了sob老师的博文:分子间轨道重叠的图形显示和计算。对于要考察的两个片段的轨道编号,我应该如何选择呢?是用Multiwfn分别取看这两个片段的HO ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-1-6 17:54:09
dqyDTT 发表于 2024-1-5 17:44
老师好,请问同一个分子中两个片段间轨道电子转移积分怎么计算呢?CDA功能有净转移多少电子,这个可以代 ...

跟CDA毫无关系
本论坛里之前不止一个人分享过基于Gaussian算的分子轨道算转移积分的程序,首页google框搜
情况适当的时候,把整个分子拆成两个片段,分别计算得到片段轨道再算转移积分
dqyDTT 发表于 Post on 2024-1-5 17:44:19
sobereva 发表于 2021-5-18 03:12
Multiwfn的CDA功能里直接就给你片段轨道间的重叠积分

使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互 ...

老师好,请问同一个分子中两个片段间轨道电子转移积分怎么计算呢?CDA功能有净转移多少电子,这个可以代替表征转移积分吗?
sobereva 发表于 Post on 2021-5-18 03:12:07
吕安琪 发表于 2021-5-5 18:02
请问同一个分子中两个片段间轨道重叠积分怎么计算

Multiwfn的CDA功能里直接就给你片段轨道间的重叠积分

使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
吕安琪 发表于 Post on 2021-5-5 18:02:21
alonewolfyang 发表于 2020-3-14 11:32
计算重叠积分行不行

请问同一个分子中两个片段间轨道重叠积分怎么计算
sobereva 发表于 Post on 2020-3-17 13:23:17
XZDZ 发表于 2020-3-15 09:19
谢谢老师。
我的结构是这样的一个复合物(是TS走IRC,走得很长之后,产物端的一个复合物),想要考察的 ...

这根本看不出有什么pi-pi作用,没必要从这个角度讨论,讨论也讨论不出什么
alonewolfyang 发表于 Post on 2020-3-15 17:22:57
本帖最后由 alonewolfyang 于 2020-3-15 17:26 编辑
XZDZ 发表于 2020-3-15 06:41
就是按照上面那篇博文里的方法求重叠积分?那两个片段的轨道怎么选择呢?

是的,按照Sob老师的做法最简单,当然也可以自己写个小程序计算
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-15 09:08:43
XZDZ 发表于 2020-3-15 06:41
就是按照上面那篇博文里的方法求重叠积分?那两个片段的轨道怎么选择呢?

这种问题没法对着文字空谈的,效率很低。不如直接给出具体问题。
XZDZ 发表于 Post on 2020-3-15 06:41:46
alonewolfyang 发表于 2020-3-14 11:32
计算重叠积分行不行

就是按照上面那篇博文里的方法求重叠积分?那两个片段的轨道怎么选择呢?
sobereva 发表于 Post on 2020-3-14 19:00:29
是pi不是pai

如果两个片段是在同一个分子里的,没法说每个片段的HOMO、LUMO,因为这是对整体而言的
看不到你的具体结构我不好说。但一个可能可行的做法是做轨道定域化(参看http://sobereva.com/380),把对应两个片段的pi轨道的定域化轨道序号找出来,然后用Multiwfn手册主功能100的子功能11计算两个片段间每一对定域化分子轨道的模的重叠积分,然后加和。

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出帖子具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的不恰当标题“新手求助:关于分子轨道计算”改了,以后务必注意。
alonewolfyang 发表于 Post on 2020-3-14 11:32:27
XZDZ 发表于 2020-3-14 11:08
我想要考察pai轨道的重叠情况的话,是不是可以先用Multiwfn分别查看这两个片段的轨道,然后选出他们的Pai ...

计算重叠积分行不行
XZDZ 发表于 Post on 2020-3-14 11:08:40
liyuanhe211 发表于 2020-3-14 10:00
考察对分子间(或分子片段间)相互作用贡献大的轨道,不一定是HOMO,LUMO(而且“一个分子结构中两个片段( ...

我想要考察pai轨道的重叠情况的话,是不是可以先用Multiwfn分别查看这两个片段的轨道,然后选出他们的Pai轨道,然后再根据前面说的sob老师的那篇博文来操作,这样得出的结果是否可靠呢?
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-14 10:00:47
考察对分子间(或分子片段间)相互作用贡献大的轨道,不一定是HOMO,LUMO(而且“一个分子结构中两个片段(各自的)HOMO/LUMO”似乎定义也不明确)

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