abin 发表于 2020-3-25 12:14 typo,B3DJ→D3BJ |
sobereva 发表于 2020-3-25 14:36 好的!非常感谢您!老师您太专业了!崇拜jpg. |
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就区区两核,也不做后HF,没必要用linux版。win和linux版对于当前研究性能没有显著区别。 你先在Gaussian里用B3LYP-D3(BJ)/6-31G*结合force关键词算一下受力,看看耗时多久,乘上20作为估计的几何优化的时间。如果能接受,用这么优化完,如果不能接受,就用Gaussian里PM6-D3(从G09 D.01开始才支持)或者PM7(从G16开始支持)做优化。答辩时候如果有老师嫌你计算级别低,你就说疫情原因只能用自己笔记本算,对方不会难为你。 单点计算用M06-2X/6-311+G**。虽然以你的计算能力耗时不低,但一次性就能算完,耐心点等等就行了。也可以根据做一轮SCF的耗时乘以15,估计跑完大概需要多少时间。如果确实算不动,建议改用ORCA做B97-3c,肯定没有压力。 之后用Multiwfn做各种弱相互作用分析(AIM、RDG、IGM、静电势分析等)用单点任务产生的波函数文件就行,这不会需要太高耗时,两核毫无压力。 |
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-3-25 14:29 编辑 Q-Chembio-llg 发表于 2020-3-25 14:17 “那种精确到每一步的输入代码的教程”是你实验室的师兄师姐。比较好的高斯教程很多,除了sob老师的博文(需详读)外,还有“量子化学”公众号文章分类->软件教程里也有一些,仔细看鼓捣鼓捣就行了。 如果你是有好几个.part的压缩文件,大概率是分卷的rar压缩文件,需先在win下解压缩。 |
zjxitcc 发表于 2020-3-25 14:06 哦哦,我这里的linux高斯的安装包分了四个part(压缩文件),我以前没接触过这种系统,请问有没有详细的那种精确到每一步的输入代码的教程啊 |
Q-Chembio-llg 发表于 2020-3-25 13:53 看sob老师博文《Gaussian的安装方法及运行时的相关问题》http://sobereva.com/439 |
abin 发表于 2020-3-25 12:14 好的谢谢大佬 |
zjxitcc 发表于 2020-3-25 13:38 好的谢谢大佬,我装了乌班图的虚拟机,也有Linux版的高斯16,但是我刚入门,不会安装也不太会用,可否留个联系方式劳烦您指导我一下?万分感谢! |
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本帖最后由 zjxitcc 于 2020-3-25 13:43 编辑 自己在电脑上装WSL(win10商店搜ubuntu即可,十分方便,无需刷系统、装双系统。不过安装要好一会儿)或VMWare虚拟机,在里面用linux g16(注意不要用g09)。 结构优化吐血推荐用高斯,计算级别B3LYP/6-31G(d) em=GD3BJ int=(fine,acc2e=10) 高精度单点可以用高斯也可以用ORCA(同样在linux下跑)。波函数分析在Win下用Multiwfn。 说实话,计算内容10天以内必然可以搞定。机器上要么用好点的笔记本,要么临时租用服务器,要么去网吧包最好的电脑(开玩笑,下下策),一点点钱(百级别)的事。 |
abin 发表于 2020-3-25 12:14 2000太贵了,都可以买一台华南整机自己算啦。 淘宝搜索出租服务器的话一个月几百就能租到还凑合的,自己装个linux虚拟机算算高斯什么的都不差。 我觉得结构优化还是得用高斯,算高精度单点倒是可以用orca。 比如你可以在B3LYP-D3/def2svpp下面用高斯先优化一下结构,然后用orca的B3LYP/G-D3/def2-tzvp算个单点。不会很慢,一个月应该能搞定?你的体系原子数也不多,很快的。 |
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无脑推荐, B3LYP/6-31G(d)/B3DJ 使用Linux系统,可能计算快点。 要不,你租用一个dedicated server做计算吧。 阿里云的有一个月报价2000多人民币的。 注意,是一台有网络的实体机器,不是虚拟机。 |
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