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使用dmol3计算小分子反应的过渡态失败

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发布时间: 2015-9-7 20:08

正文摘要:

找了半天没有发现dmol3的版面,就发在castep的版面吧 Orbital occupation is:      17  a  ( 1) alpha and    16  a  ( 1) beta  & ...

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卡开发发 发表于 Post on 2015-9-8 11:28:27
zyj19831206 发表于 2015-9-8 10:00
那看来还是gaussian更适合这个反应吧,gaussian里面有溶剂模型,我这个是工科需要计算的,要求不高,只是 ...

图QQ图片20150907200240.png (最后那副图)里面有个Use solvation model,并不是说不能算;

问题在于,算小分子还是应该使用好一些的泛函,计算量也不大,Gaussian可以选择更多的泛函以及更大的基函数,DMol3算这种体系性价比不高。

重点还是你的反应怎么考虑。

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zyj19831206 发表于 Post on 2015-9-8 10:00:45
卡开发发 发表于 2015-9-8 04:53
好像应该是缩醛反应,最后两端都是R-O-,问题是ROH加成到C=O能不能找到过渡态还挺难说,DMol3当中就算能做 ...

那看来还是gaussian更适合这个反应吧,gaussian里面有溶剂模型,我这个是工科需要计算的,要求不高,只是要知道热力学性质以及添加什么基团可以改进多聚甲醛的性能就是了。
卡开发发 发表于 Post on 2015-9-8 04:53:20
好像应该是缩醛反应,最后两端都是R-O-,问题是ROH加成到C=O能不能找到过渡态还挺难说,DMol3当中就算能做估计也只能考虑猜个结构用EF来做,可行性比较低。

还有,水溶液体系溶剂化应当考虑。
Shannon 发表于 Post on 2015-9-8 03:05:32
聚甲醛应该是这个样子,是个醇。

反应我觉得类似于醇缩合生成醚的反应,  是SN2机理,具体是酱子的。

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Shannon 发表于 Post on 2015-9-7 23:35:50
改用B3LYP试一下?BLYP经常找不到过渡态的,即使找到了能垒也低的离谱。另外,反应是 CHO 自由基 和 CH3OH反应吗? 这个反应似乎没法一步生成OCH2OCH3吧。

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