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求助：Gromacs能量最小化设置的困惑

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发布时间: 2020-4-29 23:18

正文摘要:

我一般能量最小化都采用如下设置：integrator = steep ; emtol = 1000.0 ; 视情 ...

回复 Reply

dinghongming 发表于 Post on 2020-4-30 16:46:44

sobereva 发表于 2020-4-30 06:49
通常来说没必要这么折腾，虽说这么做更稳妥一些

如果观看极小化过程中某些重原子位置变化很厉害，已经不 ...

谢谢sob老师建议！

sobereva 发表于 Post on 2020-4-30 06:49:35

通常来说没必要这么折腾，虽说这么做更稳妥一些

如果观看极小化过程中某些重原子位置变化很厉害，已经不合理了，那么再考虑文中那么做

很多文章里做模拟的流程为了绝对稳妥多做了一些步骤，其实从实际来讲很多步骤都是多余的。

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