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求助:gromacs中关于REMD收敛的图的制法

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发布时间: 2015-9-14 11:22

正文摘要:

最近在做REMD的数据处理,看到文献里有这样的图形我用gromacs不知道怎么制作,所以想请教一下如何实现,谢谢大家。

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xxj9618 发表于 Post on 2015-9-15 09:40:20
sobereva 发表于 2015-9-14 12:53
计算轨迹每一帧的回转半径Rg,然后统计一下在不同Rg数值区间内帧数各有多少,除以总帧数就是概率(这个可以 ...

谢谢sob老师,第一步我会的,我来试试第二步
sobereva 发表于 Post on 2015-9-14 12:53:34
计算轨迹每一帧的回转半径Rg,然后统计一下在不同Rg数值区间内帧数各有多少,除以总帧数就是概率(这个可以自己写个小程序,也可以用origin的频数统计),然后绘制成dot+line图即可。

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