老师您好，请问您的这个螺烯的几何结构是怎么确定的呢，gaussian优化得来的吗

shen37 发表于 2020-5-24 20:32
常温肯定是不行的，TS-GS=△G ～30 Kcal/mol.有类似的计算文献报道，只是我刚接触计算，还不是很明白怎么 ...

当前这绝对不是一个容易算的问题，5个六元环的情况还好，而你这个六个六元环的情况，边界两个六元环位阻极大，倘若实验上真是发现了可以互变，那机理肯定很复杂，很不寻常。对于缺乏经验的人更不能上来就盲目地算，先得弄清楚机理。
先去Google上多搜相关文献，如果能找到类似过程的机理研究文章可以参考，能少走不知多少弯路。

zjxitcc 发表于 2020-5-24 14:51
实验上这个常温下能互相转化么？如果有光或其他物质的辅助，那要复杂不少。如果实验上常温下不能互相转化 ...

常温肯定是不行的，TS-GS=△G ～30 Kcal/mol.有类似的计算文献报道，只是我刚接触计算，还不是很明白怎么确定过渡态。J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6031-6035.

shen37 发表于 2020-5-24 09:32
您好sob老师，谢谢您！我已经认真看过您的帖子，要利用TS寻找过渡态可以先进行柔性扫描，初步确定过渡态 ...

实验上这个常温下能互相转化么？如果有光或其他物质的辅助，那要复杂不少。如果实验上常温下不能互相转化，那你找这个过渡态未必能找到（或者找到了但能垒十分高）。

sobereva 发表于 2020-5-24 01:17
你想得太简单了，翻转显然不是一步就能翻过去的，光凭基本化学直觉就知道中间的位阻大到不可直接跨越，必定 ...

您好sob老师，谢谢您！我已经认真看过您的帖子，要利用TS寻找过渡态可以先进行柔性扫描，初步确定过渡态的结构，您可不可以给出一些针对该问题扫瞄变量和范围的建议。

你想得太简单了，翻转显然不是一步就能翻过去的，光凭基本化学直觉就知道中间的位阻大到不可直接跨越，必定有其它/多步翻转路径。

别以为QST2那么好用，仔细看
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460（http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html）

像这种明显是基元过程，很容易就能转化过去的，用QST2才有一定几率能直接给你找到过渡态