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文献中提到,上图是以[PF6]中的P原子为中心原子,分别计算表面活性剂EO基、PO基、阳离子、水分子与P原子的距离, 我也想求类似的一个距离随时间的变化,用的命令是gmx_19.3 distance -fmd.xtc -s md.tpr -n ind ...
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