最近发现如果同时跑多个ORCA任务，然后每个任务使用多个进程，即使这些任务的总进程数没有超过电脑的物理核心数，也有可能出现这种情况：用top看每个进程的CPU利用率在40%以下（并没有显著IO阻塞）。然后我在ORCA的启动命令中的输入文件路径后面加上"--bind-to none"之后再重新跑所有任务，这时每个进程的CPU利用就接近100%了。应该是默认情况下openmpi给不同的任务分配的CPU核心集合之间有明显重叠导致的。

snljty 发表于 2021-8-27 11:43
ｍpiexec -help3查看帮助菜单

好滴谢谢，我研究研究

sobereva 发表于 2021-8-27 06:35
这是OpenMPI特有的
MSMPI或许有别的办法，我没研究

谢谢老师~

ljc050512 发表于 2021-8-26 13:55
老师，请问windows版本的ORCA也能如此通过给出的rankfile设置CPU内核绑定吗？

ｍpiexec -help3查看帮助菜单

ljc050512 发表于 2021-8-26 13:55
老师，请问windows版本的ORCA也能如此通过给出的rankfile设置CPU内核绑定吗？

这是OpenMPI特有的
MSMPI或许有别的办法，我没研究

老师，请问windows版本的ORCA也能如此通过给出的rankfile设置CPU内核绑定吗？

风飞 发表于 2020-6-30 00:26
老师，请问windows版本的ORCA快还是Linux下的快？

Linux

老师，请问windows版本的ORCA快还是Linux下的快？

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exity 发表于 2020-6-2 06:08
精品内容!
能不能说明之前我觉得多给核心，计算时间反而增加并不是错觉

可能不是错觉。
之前我跑一些体系的AIMD，发现10核左右速度最快，给比如18核反倒慢一截。而且ORCA用MPI方式并行，内存消耗得大，对于吃内存厉害的任务，少给核多给内存可能比多给核少给内存更快。

精品内容!
能不能说明之前我觉得多给核心，计算时间反而增加并不是错觉