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谢谢老师 |
夜夜衣 发表于 2020-6-9 08:10 可 |
sobereva 发表于 2020-6-6 10:46 老师，再请教您下，我这个体系设置vdw-type = Cut-off 可以吗。 |
sobereva 发表于 2020-6-6 10:46 谢谢老师 |
夜夜衣 发表于 2020-6-5 11:45 没必要加色散校正。这只是定量改进色散作用能和色散作用对压力的贡献，但只是定量的，不合适的时候加了这个甚至定性都是错的，审稿人也会批评。 另外，只要范德华作用的cutoff设得稍微大一点，色散校正的影响都会迅速降低。当前你的rvdw=1.2就已经不算小了，被忽视的色散作用对结果的影响微乎其微，绝对不会因此导致动力学行为有什么不合理性。 |
本帖最后由 夜夜衣 于 2020-6-6 00:33 编辑 sobereva 发表于 2020-6-3 20:55 可是老师，如果在较大压强下加不加色散呢？例如5Mpa 10MPa。这样分子就很密集，怎么界定这个事情呢，另外 如果模拟氨气这种带氢键的体系，需要加色散矫正吗？ |
sobereva 发表于 2020-6-3 20:55 谢谢老师 |
夜夜衣 发表于 2020-6-2 11:47 用压浴肯定不行，到最后盒子会坍塌得非常小 色散校正绝对不能用，因为你的体系是非均匀的，有大量真空区，完全违背了色散校正的假设 |
sobereva 发表于 2020-6-2 08:33 老师，问题已经解决 是色散矫正的问题 |
本帖最后由 夜夜衣 于 2020-6-2 11:50 编辑 sobereva 发表于 2020-6-2 08:33 老师，您觉得我这个体系，用npt系综，同时加上热浴和压浴如何？加上色散矫正是否更合理一点，谢谢您！若用npt，那compressibility 该如何设置呢？ |
sobereva 发表于 2020-6-2 08:33 谢谢老师，先前我已经读过手册，这个问题已经解决了， |
| 具体那些文件暂时没时间看，至于energygrp_excl用了报错的那个问题，显然不能写HTR HTR，要不然氢分子之间、氢分子内的氢原子间都没有任何相互作用了，不崩溃才怪。能写CNT CNT是因为CNT已经freeze住了，因此不描述CNT的原子间的相互作用也没关系。 |
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