Peter_zhong 发表于 2020-6-11 11:33 recalc=3,maxstep=3再试 优化分子团簇就是非常折腾,得仔细看观看结构的震荡情况判断最佳做法,不是光看个曲线就能说清楚的。也可以试试opt=cartesian(此时需要去掉GDIIS) |
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| + 3 | 谢谢老师 |
本帖最后由 Peter_zhong 于 2020-6-11 11:36 编辑 sobereva 发表于 2020-6-3 21:06 2、尝试opt(gdiis,maxstep=x,notrust),x为3~5 (如下图,取上面的输出最后一帧算的,#p opt(gdiis,maxstep=5,notrust) b3lyp/6-311g(d,p) em=gd3 ) 目前目前收敛判据那还是4个 NO,是不是我的初始结构不合理,还是其他原因?还要继续算下去吗?(之后要做振动分析 loose就不考虑了) |
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Peter_zhong 发表于 2020-6-2 16:17 这体现当前机子对当前体系用这个级别优化算得动 继续跑,如果再跑50轮,收敛趋势不明朗,加上帮助收敛的关键词,诸如GDIIS之类的,此文说了: 量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法 http://sobereva.com/164 |
| 参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
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| + 3 | 谢谢 |
| 这么大的体系用2-zeta基组基本就可以了 |
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先用xtb优化一下,再用Gaussian优化,加弥散之后计算非常慢。 投机取巧应该没有问题,大不了先用g16 (g09default)优化一下再用G09跑一下 |
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本帖最后由 Peter_zhong 于 2020-6-3 19:36 编辑 游客,本帖隐藏的内容需要积分高于 150 才可浏览,您当前积分为 0 |
Peter_zhong 发表于 2020-6-2 16:17 不是说“加了D3”,是说D3常见的有两种,D3(0)和D3(BJ),括号代表阻尼类型,Gaussian里前者用EmpiricalDispersion=GD3,后者用EmpiricalDispersion=GD3BJ,不一样的。 |
Peter_zhong 发表于 2020-6-2 16:17 G09系列, 最佳并行效率是12~16核心计算,核心再多,算得可能更慢哦。 换用G16 使用所有核心,可能效果不错。 |
niobium 发表于 2020-6-2 15:15 谢谢,详细信息已经补全到下方。 |
本帖最后由 Peter_zhong 于 2020-6-2 22:36 编辑 snljty 发表于 2020-6-2 15:30 谢谢,刚漏打了,我是加了D3的,opt B3LYP/6-311g(d,p) em=gd3优化。9分子团簇,约200原子,只含、C、H、O,电脑36核+94G运行内存,Linux g09d下算,目的就是 优化+算频率。目前优化了100多步,算上中途二面角成180度报错,总共优化了2百多步了。不知道怎么看每一轮SCF多长时间,望指导。每次任务正常结束,最后那几行给出的时间都是错误的。我目前观察到一天可以优化60-80步左右。希望大佬有空帮回答一下,不胜感激~刚看了一下目前的优化状况截图如下: |
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Peter_zhong 发表于 2020-6-2 15:09 你们这不是一个问题啊,你这个还有几何优化的问题,得看你算的是什么结构,普通分子和团簇几何优化收敛需要的步数差别极大。最好说一下你有什么电脑配置,大概是多少个原子的体系,大概什么样的体系,优化了多少步,优化目前收敛情况怎么样,每一轮SCF多长时间。 |
Peter_zhong 发表于 2020-6-2 15:09 给4L顺便给楼主回复一下,只要不是G09 E.01之前版本的Gaussian要算频率,通常不对B3LYP用0阻尼的D3,一般用BJ阻尼的。 |
Peter_zhong 发表于 2020-6-2 15:09 要看多少基函数啊,还有你服务器什么样的配置啊 |
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本帖最后由 Peter_zhong 于 2020-6-11 11:34 编辑 这描述和我最近一模一样啊 不过我是用B3LYP/6-311g(d,p) em=gd3优化,优化了好几天了 不知道有没有戏 ,没出现像你这种这么严重的震荡。我是否该杀了进程,学习一下orca,按照社长说的做?各位大佬有什么建议吗? |
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