sobereva 发表于 2020-6-6 11:00 感谢老师解答。 |
|
之前有人在论坛里也问过类似的问题 F非常硬,可极化率比N、O都低,所以从可极化的角度吃亏。而且去绘制ELF等值面图的话,也会明显看到F的孤对电子分布明显没有N、O的弥散。形成氢键的时候,氢键受体关键是孤对电子部分,不能光盯着元素自身的电负性来说事。 氢键给体相同时,F、N、O作为氢键受体时的结合能差异在此文的测试集中就能看出来 透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍 http://sobereva.com/513 |
chemhou 发表于 2020-6-5 20:44 感谢老师的解答。 |
snljty 发表于 2020-6-4 11:30 你如果把F换成Cl/Br/I可能就不一样了。此外诸如CFX3 (X=Cl, Br, I),从电负性上看,F上应该为负,但实际很大可能Cl, Br, I更负。 |
我看到这个问题的第一直观反应,不是显而易见就应该是O的么!!!![]() |
风起时想你 发表于 2020-6-4 11:10 定性上来理解,F原子是元素周期表中电负性最大的但却不是电子亲和能最高的;F原子半径很小,电子分布相对比较“局域”(polarization),相比O来说并不是一个好的HB受体。 如20年前的一篇文章:https://www.sciencedirect.com/sc ... ii/0040402096007491 The C(sp3)-F...H-O bond (2.38 kcal mo1-1) is less than half the strength of a C-O...H-O and the C(sp2)-F-..H-O bond (1.48 kcal mo1-1) is about half as weak again. |
snljty 发表于 2020-6-4 11:30 感谢解答。 |
|
本帖最后由 snljty 于 2020-6-4 12:24 编辑 我之前算三氟一溴甲烷分子的时候,发现氟的静电势并不是很负。说的通俗一点儿,可能不那么严谨。 一个氟连在碳上吸电子效果很强,一氟甲烷的分子van der Waals表面静电势碳明显很正,氟明显很负。 三氟甲烷中,三个氟吸电子效果肯定强于一个氟,但是由于碳已经有了一定正电性,想让静电势更正会变得更难。所以三个氟的吸电子效果明显达不到一个氟的三倍。但是“吸走”的这些电子却要被三个氟评分,导致三个氟的静电势远没有一氟甲烷的氟那么负。自然作为氢键受体的能力也更差。 更何况这个分子,中间的部分也会来吸电子分一杯羹,导致实际每个氟的静电势没有那么负。 下面是一氟甲烷和三氟甲烷的分子van der Waals表面(电子密度0.001等值面)静电势填色图(含静电势极值点标记),色彩刻度没贴,但是都是-0.03~0.03,蓝负红正。和上面的描述一样。计算级别M06-2X/def2-TZVPP//B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP
下次不贴这么大图浪费论坛空间了...我错了 |
sobereva 发表于 2020-6-4 08:39 对NTF2分子进行了静电势分析,发现两个极小点位于氧原子附近,并且氟原子附近出现了几个极大点。氟原子的电负性不是强于氧原子吗,氟原子的孤对电子应该也会对静电势也有负贡献啊,为什么极小点不位于氟原子附近呢?希望老师给与指点一下。 |
|
最简单的解释方法:用Multiwfn做定量分子表面分析,考察氧附近的范德华表面静电势极小点和氟附近的差异。在忽略极化作用的前提下,谁的静电势越负,谁成为氢键受体的能量越强。如果没有位置恰当的极小点,直接看原子附近的范德华表面的上的静电势的数值(通过作图,根据上面的颜色判断静电势大小),或者用Multiwfn计算原子对应的局部范德华表面的静电势平均值。 参考 使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用 http://sobereva.com/159 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示) http://sobereva.com/443(http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html) 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 http://sobereva.com/196 也可以考察静电势全局极小点 绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法 http://sobereva.com/493(http://bbs.keinsci.com/thread-13638-1-1.html) |
|
本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-6-4 00:33 编辑 感谢提供了一个极好的波函数分析练习题 ,分子不大,又有实际应用价值,有充分实验数据,又稍微违背经典化学的直观,有现象有分析有根源 。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-20 05:53 , Processed in 1.487108 second(s), 25 queries , Gzip On.