| 求个in文件万分感谢 |
| 请教楼主我也在练习气体吸附在硅基质中,但是设置参数时,有写参数不知改如何设置,能否请楼主分享一下自己的in文件,学习一下呢,在此谢过了 |
Lacrimosa 发表于 2022-1-13 21:24 我目前是切平面后构建layer直接sorption的。如果需要通过力场来决定表面结构,只需要几何优化嘛还是需要NVT跑MD? |
WB1040720479 发表于 2022-1-12 16:14 表面层原子的化学环境和体相本身就不同,结构不一样很正常。很多力场开发者已经考虑到了这个问题,所以由力场参数去决定表面结构更合理。在水-黏土的界面研究中就出现过类似的问题,旧力场参数未考虑到表面羟基的柔性,导致水在表面的分布不合理,文章标题我记不清了,应该是Cygan.R.T的某篇文章里提到的。至于是否会减小吸附量没法直接判断。 |
Lacrimosa 发表于 2022-1-6 13:14 就是在MS的sorption中是否将基底完全固定对结果没有什么影响,不知道在lammps是否一样;然后如果一般表面层不固定做结构优化后原子分布会发生变化,能量降低,这个操作应该会减小原子的吸附量吧?实际吸附过程吸附质不影响表面原子分布吧? |
WB1040720479 发表于 2022-1-4 14:04 如果你指的是将整个二氧化硅完全固定,那就不合理。如果只固定非表面层的部分是可以接受的,但有这么做的必要吗? |
WB1040720479 发表于 2022-1-4 14:03 会,界面处辛烷的密度分布可能会出现两个峰(沿垂直于界面方向) |
Lacrimosa 发表于 2020-6-11 10:46 请问您一下,如果我将基底完全固定,然后再吸附这样设置合理吗? |
| 请问一下靠近表面的辛烷会出现密度大于其余部分的情况嘛? |
| 请问一下靠近表面的辛烷会出现密度大于其余部分的情况嘛? |
li447fan 发表于 2020-11-16 21:55 你好,气相和液相设置解决了吗? |
k64_cc 发表于 2020-6-9 12:03 请问气相和液相是如何设定的呢 |
shun 发表于 2020-6-10 15:54 NVT是平衡态采样,有热浴影响,会干扰你想看到的“铺展过程”。你可以考虑把液相的slab和固相的SiO2分别平衡,然后放在一个box里跑NVE。在这种方案下,如果有得选,垂直于界面的方向还是别用PBC为好。 |
shun 发表于 2020-6-11 09:03 为什么要固定二氧化硅呢?力场参数合理的情况下一般不会有很大的变化的 |
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