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请问lammps在NVT控温时出现“lost atoms”的错误该如何解决？

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vayne

发布时间: 2020-6-11 08:53

正文摘要:

大家好，请问在NVT控温时出现图1中情况是什么原因？温度从一开始就涨至成千上万，导致原子丢失。我的neighbour设置是默认值，“2.0 bin”。在查阅资料过程中，有人给出3种解决办法：1，reduce timestep;2,change ...

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yjw1204338757 发表于 Post on 2022-12-7 09:51:10

我也遇到过同样的问题，最后发现是构型不合理

a75465182 发表于 Post on 2022-8-21 21:36:49

以我个人的经验，90%以上的情况是立场或初始构型参数有问题。
温度高是因为有奇怪的力，或者没有minimize，且有距离过近的原子。
一行行检查立场参数。

LGX 发表于 Post on 2022-8-21 20:30:07

1、可能是模型有问题 2、边界条件设置的有问题 3、力场可能存在问题

lizhi333 发表于 Post on 2022-4-21 10:43:13

你好，请问问题解决了么？最后如何解决的呢？

tony283 发表于 Post on 2020-6-12 16:16:09

A Nose-Hoover thermostat will not work well for arbitrary values of Tdamp. If Tdamp is too small, the temperature can fluctuate wildly; if it is too large, the temperature will take a very long time to equilibrate. A good choice for many models is a Tdamp of around 100 timesteps.
0.05 Tdamp这个设置是照着文献做的吗？肯定不合理。

sobereva 发表于 Post on 2020-6-11 22:22:21

vayne 发表于 2020-6-11 09:13
才发现图片很模糊，给老师们带来的不便还请谅解！

编辑帖子重新上传图片就完了，不用在这里说

vayne 发表于 Post on 2020-6-11 09:13:59

才发现图片很模糊，给老师们带来的不便还请谅解！

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