muuu2333 发表于 2021-5-16 17:12
找到方法了，用片段初猜，不用扫描

能不能解释的详细点呢？最近也是自由基让人头大

muuu2333 发表于 2021-5-16 17:12
找到方法了，用片段初猜，不用扫描

找到方法了，用片段初猜，不用扫描

lijiayisjtu 发表于 2021-5-5 09:51
老哥 对于成键断键 你这么做 应该OK的 以及可以看些涉及自由基 过渡态的计算的 文献 还是很多的

嗯嗯，我看了一些文献，只是画出了势能面代表人家找出来了，还没有找到有具体的操作方法的文献，我再找找看

lijiayisjtu 发表于 2021-5-5 09:50
您说的很对，对于成键断键的TS 确实是这么找，有些基团转动的TS 还存在

我确实优化出来一个甲基转动的过渡态

muuu2333 发表于 2021-5-4 18:28
想问一问您不存在的判据是什么呢，我扫描拉长形成的那条键，很远都没有拐点是否能说明没有过渡态呢

老哥 对于成键断键 你这么做 应该OK的 以及可以看些涉及自由基 过渡态的计算的 文献 还是很多的

wzkchem5 发表于 2021-5-5 00:17
我一般是拉到成键的两个原子的距离大于范德华半径之和，如果到这里没有过渡态，那就认定为没有过渡态。
...

您说的很对，对于成键断键的TS 确实是这么找，有些基团转动的TS 还存在

muuu2333 发表于 2021-5-4 11:28
想问一问您不存在的判据是什么呢，我扫描拉长形成的那条键，很远都没有拐点是否能说明没有过渡态呢

我一般是拉到成键的两个原子的距离大于范德华半径之和，如果到这里没有过渡态，那就认定为没有过渡态。
数学上讲这个方法不总是保险的，但是如果在键长大于范德华半径之和的地方有过渡态，那可以合理地说这不是“断键”的过渡态，而是非共价相互作用的过渡态。

lijiayisjtu 发表于 2021-5-3 10:01
我就是扫描 成键 断键的距离 然后发现有些步骤 确实不存在TS

想问一问您不存在的判据是什么呢，我扫描拉长形成的那条键，很远都没有拐点是否能说明没有过渡态呢

muuu2333 发表于 2021-5-2 21:31
您好，我最近也在算两个自由基结合的过渡态，想问一问您最后是怎么解决的呢

我就是扫描 成键 断键的距离 然后发现有些步骤 确实不存在TS

lijiayisjtu 发表于 2020-6-12 16:59
谢谢师兄的建议，我发帖时比较匆忙，我再编辑下，曲线应该是C12-H13距离增大过程中的变化（横坐标Gaussvi ...

您好，我最近也在算两个自由基结合的过渡态，想问一问您最后是怎么解决的呢

liyuanhe211 发表于 2020-6-12 16:42
最好把图插到正文里，不要堆成附件。

把“C7-H14拉开”是不是写错原子编号了？另外扫描的坐标怎么是个负 ...

谢谢师兄的建议，我发帖时比较匆忙，我再编辑下，曲线应该是C12-H13距离增大过程中的变化（横坐标Gaussview给的，我也不知道为什么不对应真实距离）如果H13自由基从远端靠近C12，曲线反一下，能量一路降低直到C-H成键，据此我觉得该过程无势垒，师兄您再看看， 额你说的downhill是指？额如果没有势垒，不就没有TS，也就没有IRC存在了嘛

最好把图插到正文里，不要堆成附件。

把“C7-H14拉开”是不是写错原子编号了？另外扫描的坐标怎么是个负值？

这个反应无势垒不奇怪，听起来是比较合理的。如果扫描时氢接近的角度是合理的，感觉据此声称其无势垒问题不大。还有个办法是将氢放到合适的、远离的位置上，然后走downhill IRC，看能否平滑的连到最终产物

061-3图，左下角是柔性扫描过程中自旋布居的变化，右下角是扫描最后一步结构的自旋布居分析