计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

使用Multiwfn+VMD快速地绘制 pt任务失败得不到pdb文件

查看数: 5219 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2020-6-17 19:29

正文摘要:

按照《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》(http://sobereva.com/443)的做法,iso.bat 没有问题,能得到VMD路径下的cube文件,能顺利绘制之ESP图。但是 pt.bat 后得不到pdb文 ...

回复 Reply

辣椒丛中水果糖 发表于 Post on 2020-6-26 23:06:04
系统提示字符“<"为预留字符
将“ < "左右两边的空格去掉就可以正常运行bat文件,生产pdb文件了~
sobereva 发表于 Post on 2020-6-21 03:14:29
辣椒丛中水果糖 发表于 2020-6-18 14:15
sob老师,测试运行到第四行0 开始分析后自动退出了。

在命令行下执行Multiwfn,看自动退出后屏幕上都有什么报错提示,说不清楚的话截个图
辣椒丛中水果糖 发表于 Post on 2020-6-18 14:15:42
sobereva 发表于 2020-6-18 12:06
自行把命令一行行敲进去自然就知道哪里有问题了

sob老师,测试运行到第四行0 开始分析后自动退出了。
sobereva 发表于 Post on 2020-6-18 12:06:59
自行把命令一行行敲进去自然就知道哪里有问题了
辣椒丛中水果糖 发表于 Post on 2020-6-17 20:17:31
1 用的是Multiwfn官网上的最新版本
2 确保ESPiso.bat或ESPpt.bat里的VMD路径设对了。如果路径有空格,两边必须用双引号括起来。
3 确保上述bat文件里输入文件的路径无误
4 确保用的输入文件的文件格式为sob的模板
6 死活搞不明白原因的话,先进入操作系统的命令行模式,比如Windows的cmd(不会进的话自行Google搜索),并且确保当前处在Multiwfn目录下,然后把.bat批处理文件里的命令(中的跟当前情况有关的部分)一行一行敲进去运行,从屏幕的提示上判断是因为什么出错并试图解决。—— 系统提示字符“<"为预留字符,所以无法分析命令的错误。
所以input里面哪里需要是浮点数。。。。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 23:04 , Processed in 1.408008 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list