如何计算AIMD过程的化学键数目？

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发布时间: 2020-6-19 14:53

各位老师，我用VASP计算了复合物AB层模型10p's的AIMD，我希望能得到10ps内，A-B、A-A、B-B化学键数目随时间的变化，应该怎么做呢？是使用哪个软件或者写脚本什么的？这是参考论文中的图

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yiranfengbai 发表于 Post on 2020-6-20 10:01:44

agent99 发表于 2020-6-20 01:46
如果化学键是根据原子间距离定义的话就很容易吧

是根据原子间距定义的

yiranfengbai 发表于 Post on 2020-6-20 09:59:14

sobereva 发表于 2020-6-19 18:36
自己写个VMD的tcl脚本统计，撑死了超不过20行就能解决

好的，谢谢社长

agent99 发表于 Post on 2020-6-20 01:46:50

如果化学键是根据原子间距离定义的话就很容易吧

sobereva 发表于 Post on 2020-6-19 18:36:18

自己写个VMD的tcl脚本统计，撑死了超不过20行就能解决

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