sobereva 发表于 2020-6-21 02:45
怎么也应该放在1.5埃以内。参考原子共价半径
建立模型不要卡着极限，否则边界效应强，审稿人很容易质疑 ...

好的，谢谢sob老师

Abner 发表于 2020-6-20 10:14
首先谢谢sob老师的解答，非常感谢。那老师这个距离放在多远是比较合适的？
您的第二个回复：通常情况下 ...

怎么也应该放在1.5埃以内。参考原子共价半径
建立模型不要卡着极限，否则边界效应强，审稿人很容易质疑你。明明当前体系也不大，多加两个环也不是算不动

sobereva 发表于 2020-6-19 21:41
1 对于化学吸附，显然不适合放在3埃，这样有可能得到对应物理吸附的极小点结构

2 你的模型都和文献不一 ...

首先谢谢sob老师的解答，非常感谢。那老师这个距离放在多远是比较合适的？
您的第二个回复：通常情况下这个模型是3-7个苯环的（已经经过验证是合理的），这里主要的特点是3个连续的活性C原子，只要有3个连续的活性C原子，吸附方式通常都是文献里的那个途径，就是第二个NO分子以O-down模式吸附，后来的N原子靠近内侧N原子

1 对于化学吸附，显然不适合放在3埃，这样有可能得到对应物理吸附的极小点结构

2 你的模型都和文献不一样，应当用更大的石墨烯模型，减小边界效应。