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利用multiwfn获得.inp文件,在orca中运行报错问题

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发布时间: 2020-6-30 20:10

正文摘要:

这两天安装了ORCA,成功运行的简单的test.inp(如图),自己认为安装成功了,但是通过Multiwfn获得H2O.inp(如图),在orca中运行出现如图错误,是我软件没有安装成功还是核数关键词的设置问题呢?     ...

回复 Reply

wzkchem5 发表于 Post on 2020-9-3 20:19:54
并行计算调用orca时应该用绝对路径,如果通过定义$PATH的方式,orca可能没有办法在正确的文件夹里寻找orca_gtoint_mpi程序。比如从你的Calling Command输出看,orca尝试在你的输入文件所在的目录下调用orca_gtoint_mpi,结果没找到,这个可能就是报错的原因
dongdong 发表于 Post on 2020-9-2 15:50:53
teller3531 发表于 2020-8-31 19:12
您好遇到和您一样的问题
您说的最后发现不能再root下安装是指orca不能装在root下还是openmpi那,谢谢了

不能再root下运行,
teller3531 发表于 Post on 2020-8-31 19:12:09
dongdong 发表于 2020-7-2 22:19
谢谢您的回复,最后发现不能再root下安装。

您好遇到和您一样的问题
您说的最后发现不能再root下安装是指orca不能装在root下还是openmpi那,谢谢了
dongdong 发表于 Post on 2020-7-2 22:19:19
rabbitkiller 发表于 2020-7-2 16:03
换个不是root的账户试试看呢?

谢谢您的回复,最后发现不能再root下安装。
rabbitkiller 发表于 Post on 2020-7-2 16:03:54
换个不是root的账户试试看呢?
dongdong 发表于 Post on 2020-7-2 11:31:41
thanhtam 发表于 2020-7-1 22:57
which mpirun看看呢?

谢谢回复!之前试过了,在指定的目录下。
thanhtam 发表于 Post on 2020-7-1 22:57:01
which mpirun看看呢?
dongdong 发表于 Post on 2020-7-1 22:54:27
naonao5205 发表于 2020-7-1 21:50
可能是linux换行符和win10下不一样导致的
我改换行的脚本

谢谢您的回复!应该不是输入文件的问题,只要并行就会报错,穿行就可以。所以怀疑是MPI库或者ORCA 的问题,但是前面已经讲到OPENMPI安装正确,二ORCA安装也解压加个路径就可以了。所以不知道这样报错的问题出在哪。
naonao5205 发表于 Post on 2020-7-1 21:50:08
本帖最后由 naonao5205 于 2020-7-1 21:51 编辑

可能是linux换行符和win10下不一样导致的
我改换行的脚本
  1. #! /bin/bash
  2. for inf in *.inp
  3. do
  4. echo doing ${inf}
  5. time sed -i 's/\r//'  ${inf}
  6. echo ${inf} done
  7. done
复制代码


sobereva 发表于 Post on 2020-7-1 20:27:25
dongdong 发表于 2020-7-1 10:53
昨天尝试用openmpi314 和orca421,按照之前一样的安装,发现运行后一样的报错,所以我开始怀疑是不是由于 ...

这和动态还是静态的没关系
远程说不清楚。实在不行就装个虚拟机或者通过WSL用linux版ORCA
dongdong 发表于 Post on 2020-7-1 10:53:55
本帖最后由 dongdong 于 2020-7-1 10:59 编辑
sobereva 发表于 2020-6-30 21:33
换成最新版ORCA再试

昨天尝试用openmpi314 和orca421,按照之前一样的安装,发现运行后一样的报错,所以我开始怀疑是不是由于我多次安装导致系统某些地方弄错了,于是在电脑虚拟机也尝试了,还是这样报错。
ORCA finished by error termination in GTOInt
Calling Command: mpirun -np 4  ./orca_gtoint_mpi H20.int.tmp H20
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run
再试试静态版的orca,看看行不行。


sobereva 发表于 Post on 2020-6-30 21:33:06
换成最新版ORCA再试
sobereva 发表于 Post on 2020-6-30 20:12:34
输入文件没问题。先尝试串行计算看能否成功,能的话可能MPI库有问题。
另外注意并行核数不要超过物理核数

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