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安装ORCA 4.2.1 后运行测试文件,出错

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发布时间: 2020-7-3 16:23

正文摘要:

本帖最后由 风飞 于 2020-7-4 14:25 编辑 老师,您好,        根据您的帖子http://sobereva.com/451 在centos 7.8 下安装ORCA 4.2.1 ,OpenMPI 已安装正确,相关环境变量设置如下,结果运 ...

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万里云 发表于 Post on 2020-7-5 10:19:32
风飞 发表于 2020-7-4 14:40
嗯,抱歉,我还是没理解,您说的是这个图吗?,我shell前面是$,我就一直以为普通用户,我记得root用户 ...

我看花眼了,把room看成root了。
风飞 发表于 Post on 2020-7-4 14:40:06
万里云 发表于 2020-7-4 13:48
你最后一张图执行mpiexec的时候,用的是root账户啊。

root账户应该只在修改系统设置的时候使用。平时 ...

嗯,抱歉,我还是没理解,您说的是这个图吗?,我shell前面是$,我就一直以为普通用户,我记得root用户的shell前面不是#吗?我还是没明白,如果改,怎样改合适呢?我先在在终端中都是这样([room@localhost ] $)的形式
万里云 发表于 Post on 2020-7-4 13:48:09
风飞 发表于 2020-7-3 22:42
嗯,谢谢您,我明天装一下这个软件,此外,谢谢您的提醒,我应该用的是普通用户,我看书上说:如果是root ...

你最后一张图执行mpiexec的时候,用的是root账户啊。

root账户应该只在修改系统设置的时候使用。平时就用root的话,即使不手滑把系统搞坏,也容易遇到令人头疼的文件权限问题。
喵星大佬 发表于 Post on 2020-7-3 22:49:34
风飞 发表于 2020-7-3 22:42
嗯,谢谢您,我明天装一下这个软件,此外,谢谢您的提醒,我应该用的是普通用户,我看书上说:如果是root ...

一样的,~/是相对路径,对于root用户就是/root/,对普通用户就是/home/用户名/
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 22:42:06
本帖最后由 风飞 于 2020-7-3 22:46 编辑
万里云 发表于 2020-7-3 22:21
切换mpi的问题可以用Environment Modules软件解决。

看截图你在用root账户,对于新手来说,这是个很糟 ...

嗯,谢谢您,我明天装一下这个软件,此外,谢谢您的提醒,我应该用的是普通用户,我看书上说:如果是root用户前面应该是# ,而普通用户是$,您是说我在root用户的bashrc上修改的环境变量吗?我每次打开bashrc文件用的命令是  gedit ~/.bashrc 。如果这个打开的是root用户的bashrc文件,请问我该用哪个命令打开当前普通用户的bashrc文件呢?

万里云 发表于 Post on 2020-7-3 22:21:57
风飞 发表于 2020-7-3 21:14
你好我想请问以下,VASP 用的是inter MPI  ORCA 用的是openMPI 。 我现在使用ORCA 把interMPI 注释了,那 ...

切换mpi的问题可以用Environment Modules软件解决。

看截图你在用root账户,对于新手来说,这是个很糟糕的习惯。
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 21:14:39
hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:17
注释以后要退出重新登录。

删了就没了。

你好我想请问以下,VASP 用的是inter MPI  ORCA 用的是openMPI 。 我现在使用ORCA 把interMPI 注释了,那我使用interMPI的时候是不是也要把openMPI 注释掉呢?
如果我使用VASP 的时候,把interMPI 的注释去掉,然后给openMPI加上注释,这样修改好hashrc ,是不是点击source .bashrc 就可以了?
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 21:02:35
最后,谢谢各位老师
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 21:02:20
hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:17
注释以后要退出重新登录。

删了就没了。

您好,我在回收站把文件找回来了,然后修改PATH 路径并且注释了inter MPI   然后就可以了
hebrewsnabla 发表于 Post on 2020-7-3 20:17:05
风飞 发表于 2020-7-3 20:14
其实我之前是先注释了inter MPI ,然后输入mpiexec -V 结果还是inter MPI,然后我就 删除了,请问现在该 ...

注释以后要退出重新登录。

删了就没了。
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 20:14:03
hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:04
安装openmpi和intel没有关系,没报错就是成功的。根本没必要重新安装。

安装的时候要先阅读README和IN ...

其实我之前是先注释了inter MPI ,然后输入mpiexec -V 结果还是inter MPI,然后我就 删除了,请问现在该怎么办呢?
hebrewsnabla 发表于 Post on 2020-7-3 20:04:01
风飞 发表于 2020-7-3 20:01
嗯,之前也是按照帖子来的,输入make all intsall -j,没有提示报错,结果可能是inter MPI 的原因,openM ...

安装openmpi和intel没有关系,没报错就是成功的。根本没必要重新安装。

安装的时候要先阅读README和INSTALL。
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 20:02:18
hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 19:57
export LD_LIBRARY_PATH=/home/room/openmpi314/lib:$LD_LIBRARY_PATH

当然,你把其他的mpi都注释掉, ...

恩,好的  谢谢您
风飞 发表于 Post on 2020-7-3 20:01:17
hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 19:53
不需要重新安装啊……

你非要重装,之前怎么装的还怎么装呗

嗯,之前也是按照帖子来的,输入make all intsall -j,没有提示报错,结果可能是inter MPI 的原因,openMPI 没有装成功,这次我把inter MPI注释掉了,然后重新来输入 make all intsall -j  结果就提示出错了

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