请教ms生成水分子，导出的car文件，经过msi2lmp转换后原子ID修改问题

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发布时间: 2020-7-8 11:14

如图所示，在data文件中，氢原子自动分配了1号，而氧原子则自动分配了2号。但是在tip4p的势函数中，只能是氧原子是1，而氢原子是2。否则会出现以下错误：请问如何修改ms，使得经过msi2lmp转换后，把氢原子 ...

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armstrong 发表于 Post on 2020-7-10 19:20:13

Lacrimosa 发表于 2020-7-10 10:52
水分子的力场参数不是很复杂，可以直接把参数中的序号调换一下

原子太多了，手动调也太麻烦了

Lacrimosa 发表于 Post on 2020-7-10 10:52:56

armstrong 发表于 2020-7-9 12:03
好的，社长大人

水分子的力场参数不是很复杂，可以直接把参数中的序号调换一下

armstrong 发表于 Post on 2020-7-9 12:03:21

sobereva 发表于 2020-7-9 05:37
标题里别用叹号，太有攻击性，给你改了

仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确上传图片

好的，社长大人

sobereva 发表于 Post on 2020-7-9 05:37:13

armstrong 发表于 2020-7-8 11:19
图片丢了，1 1.007970 # h*，2 15.999400 # o*。在msi2lmp转化后的data文件中，自动给氢原子分配了序号1 ...

标题里别用叹号，太有攻击性，给你改了

仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确上传图片
有人回复前，对帖子的任何修改绝对不要在回帖里说，而是要直接编辑原帖

armstrong 发表于 Post on 2020-7-8 11:19:43

本帖最后由 armstrong 于 2020-7-8 11:20 编辑

图片丢了，1 1.007970 # h*，2 15.999400 # o*。在msi2lmp转化后的data文件中，自动给氢原子分配了序号1，给氧原子分配了序号2.我想在data文件中把顺序换过来，变成氧原子1，氢原子2

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