zjxitcc 发表于 2020-7-13 17:06 嗯嗯,好的,谢谢,我再仔细看下您发的帖子和定义。 |
qooqooli 发表于 2020-7-13 17:01 Fe3+有5个单电子,自旋多重度是6。若你底下的有机分子没有单电子(这是我的假设,由你自己判断),那么整体自然也是5个单电子,自旋多重度是6。 “自旋多重度是不确定的”不能这么讲,是先推断出几个常见的自旋多重度,然后都算一下。想知道怎么算,自然是先搞清楚自旋多重度的定义和公式 |
zjxitcc 发表于 2020-7-13 16:46 我看一些帖子,按过渡金属的体系,自旋多重度是不确定的,需要一个一个计算,找出单点能最低的那个,那么用碎片的话 该如何确定?那这个体系自旋多重度如何确定啊?总体的自旋多重度又如何确定啊?很懵逼? ![]() |
3 7 0 1 3 6有误 先把自旋多重度写对。整体的自旋多重度不是片段的自旋多重度加和。 另,还不如上传gjf文件省事。每次贴得实在是太长了。 |
zjxitcc 发表于 2020-7-13 16:04 按照您说的方法第一步的输入文件如下:但是一直报错。很懵逼当中 %chk=C:\Users\LQ\Desktop\6-Fe.chk #p ub3lyp/6-31g(d) guess(fragment=2) Title Card Required 3 7 0 1 3 6 C(Fragment=1) -5.48872521 -4.84829834 -0.00044900 C(Fragment=1) -4.09587721 -4.84829834 -0.00044900 C(Fragment=1) -3.38741421 -3.63981334 -0.00044900 C(Fragment=1) -4.10452721 -2.41520434 -0.00041100 C(Fragment=1) -5.52366121 -2.42454034 -0.00038100 C(Fragment=1) -6.20047121 -3.65095834 -0.00048400 C(Fragment=1) -1.94835921 -3.59773134 -0.00038400 C(Fragment=1) -3.39574121 -1.16939934 -0.00019200 C(Fragment=1) -1.97665321 -1.16007634 -0.00015700 C(Fragment=1) -1.27753521 -2.41859734 -0.00029500 C(Fragment=1) -1.29981021 0.06641366 0.00000000 C(Fragment=1) -2.01153321 1.26368466 0.00015100 C(Fragment=1) -3.40444821 1.26368466 0.00017800 C(Fragment=1) -4.11287421 0.05524866 -0.00003000 C(Fragment=1) -5.55196121 0.01311966 -0.00024000 C(Fragment=1) -6.22277721 -1.16599834 -0.00039500 H(Fragment=1) -7.32334521 -1.19405234 -0.00091800 H(Fragment=1) -6.09026821 0.97346766 -0.00015800 H(Fragment=1) -1.41019621 -4.55813134 -0.00068000 H(Fragment=1) -6.03294321 -5.80478134 -0.00071200 H(Fragment=1) -0.17698621 -2.39065234 -0.00058200 H(Fragment=1) -1.46740821 2.22025166 0.00012600 O(Fragment=1) -7.63037386 -3.66763642 -0.00097790 H(Fragment=1) -7.94025271 -4.57624764 -0.00011068 O(Fragment=1) -3.37965865 -6.08601033 -0.00057117 H(Fragment=1) -4.00240981 -6.81661330 -0.00002820 O(Fragment=1) -4.12055148 2.50146336 0.00020139 H(Fragment=1) -3.49773221 3.23200830 0.00069403 O(Fragment=1) 0.13009199 0.08313817 -0.00004159 H(Fragment=1) 0.43994103 0.99175990 0.00028938 Fe(Fragment=2) -3.60296838 -0.93093385 1.73305073 |
qooqooli 发表于 2020-7-13 15:44 不对。没认真看博文,强烈建议再读至少一遍。 先说说错误:这不是个单重态计算,怎么能写rb3lyp。 再说说不合适的:LANL2DZ精度一般,至少也应该用LANL2DZdp或LANL2TZ(f)。若这两个你不懂在高斯里怎么写,建议你用SDD,省事。 最后说说计算步骤: Step1.使用片段组合波函数构建初猜 Step2.读取构建好的初猜进行计算,收敛后测试波函数是否稳定 Step3.读取收敛好的波函数,进行结构优化 |
zjxitcc 发表于 2020-7-13 14:52 这是我新写的输入文件,您看下对吗? %chk=C:\Users\LQ\Desktop\6N-fe.chk #p opt rb3lyp/genecp guess(fragment=2) em=gd3bj Title Card Required 3 7 0 1 3 6 C(Fragment=1) -3.51854200 0.00000000 -0.00034800 C(Fragment=1) -2.79616700 -1.20081600 -0.00029000 C(Fragment=1) -1.40767400 -1.23747400 -0.00014900 C(Fragment=1) -1.40767400 1.23747400 -0.00009500 C(Fragment=1) -2.79616700 1.20081600 -0.00024800 C(Fragment=1) -0.67737200 -2.45606700 -0.00010300 C(Fragment=1) 0.71518000 0.00000000 0.00006800 C(Fragment=1) 1.40882500 -1.23344600 0.00010300 C(Fragment=1) 0.67957800 -2.47980200 0.00001500 C(Fragment=1) 2.81423600 -1.20161600 0.00022900 C(Fragment=1) 3.52032500 0.00000000 0.00031900 C(Fragment=1) 2.81423600 1.20161600 0.00029000 C(Fragment=1) 1.40882500 1.23344600 0.00016600 C(Fragment=1) 0.67957800 2.47980200 0.00014600 C(Fragment=1) -0.67737200 2.45606700 0.00002000 H(Fragment=1) -1.25786800 3.37020200 0.00000000 H(Fragment=1) 1.23227100 3.40978000 0.00023500 H(Fragment=1) -1.25786800 -3.37020200 -0.00017200 H(Fragment=1) -4.60533100 0.00000000 -0.00050200 H(Fragment=1) 1.23227100 -3.40978000 0.00004800 H(Fragment=1) 4.60910400 0.00000000 0.00040700 O(Fragment=1) 3.45449300 2.41099600 0.00037500 H(Fragment=1) 4.41121200 2.25805700 0.00049400 O(Fragment=1) -3.43687900 -2.41221200 -0.00038000 H(Fragment=1) -4.39173600 -2.25175900 -0.00044500 O(Fragment=1) 3.45449200 -2.41099600 0.00025400 H(Fragment=1) 4.41121200 -2.25805800 0.00035900 O(Fragment=1) -3.43687900 2.41221200 -0.00031100 H(Fragment=1) -4.39173600 2.25175900 -0.00022500 N(Fragment=1) -0.68463340 -0.01950813 -0.15814154 Fe(Fragment=2) -0.74323654 0.18149704 1.47065662 Fe 0 lanl2dz **** C H O N 0 6-31G* **** Fe 0 lanl2dz |
zjxitcc 发表于 2020-7-13 14:52 谢谢您的指点, ![]() (1)fragment1:Fe3+,总电荷3+,自旋多重度6 (2) fragment2: 石墨烯,总电荷0,自旋多重度1 ,您看这样对吗? |
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-7-13 14:54 编辑 qooqooli 发表于 2020-7-13 14:48 要构建合适的波函数初猜,读sob老师博文《谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态》http://sobereva.com/82 另,你这自旋多重度确定是对的而不是xia写的。。。?单重态? |
thanhtam 发表于 2020-7-13 14:36 谢谢您的回帖,谢谢提醒,不好意思,打错了字,但是我这个分子结构其实很简单,优化分子大概半小时就能算完,但是体系加上Fe3+后,算了一天了,SCF还是一直在循环,请问下这合理吗?你说的那个帖子我看过,我这个体系是一直在循环,不是SCF不收敛,感觉不是很匹配,以前用不含N的体系SCF不收敛,试过几个方法,还是没能解决,小白一个,问题太多。 |
本帖最后由 thanhtam 于 2020-7-13 14:39 编辑 首先要把字写对,是Gaussian不是guassian,是萘不是奈。(而且你这也不是萘,是芘) 第一个问题,看http://sobereva.com/61 第二个问题,几何优化本来就是要一遍遍地做SCF直到几何优化收敛的,你这个“不断循环”是正常的。 |
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