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求助 Gromacs mdp命令参数确认

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发布时间: 2020-7-16 22:32

正文摘要:

本帖最后由 风飞 于 2020-7-17 00:40 编辑 老师,        我打算研究甲苯和水之间的弱相互随着温度(0K-373K)的变化动力学,        问题1: 我的体系设置为20个Tolu ...

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sobereva 发表于 Post on 2020-7-18 10:54:20
bobosiji 发表于 2020-7-17 11:06
楼主问"甲苯和水之间的弱相互": 这个用Classical MD做合适么?或者说,
现在的Classical MD FF描述弱相 ...

太适合了
没必要用可极化力场
bobosiji 发表于 Post on 2020-7-17 11:06:08
sobereva 发表于 2020-7-17 09:37
1 取决于具体想研究的情况。模型怎么搭纯粹看研究目的

eq阶段不要用柔性水

楼主问"甲苯和水之间的弱相互": 这个用Classical MD做合适么?或者说,
现在的Classical MD FF描述弱相互作用的准确度如何?
可极化力场呢?多谢提点~
风飞 发表于 Post on 2020-7-17 10:33:12
sobereva 发表于 2020-7-17 09:37
1 取决于具体想研究的情况。模型怎么搭纯粹看研究目的

eq阶段不要用柔性水

好的 谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2020-7-17 09:37:11
1 取决于具体想研究的情况。模型怎么搭纯粹看研究目的

eq阶段不要用柔性水

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