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求助:gromacs采样时应如何选择位置限制条件

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发布时间: 2020-7-19 17:41

正文摘要:

本帖最后由 zhangzh 于 2020-7-19 18:02 编辑 如图,我从一条轨迹中以0.15nm为间距抽取出了等距的窗口,但是在后续的md模拟中,wham直方图显示部分窗口中的分子脱离了原有的位置。我已经对主体分子添加了位置限制 ...

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zhangzh 发表于 Post on 2020-7-20 10:03:08
wyb 发表于 2020-7-20 09:11
是不是力太大了?histogram都没有形成分布

老师好,请问力太大是指牵引力还是posre.itp里的力常数呢,那应该怎么设置合适
wyb 发表于 Post on 2020-7-20 09:11:21
是不是力太大了?histogram都没有形成分布

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