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求助：如何作圆形的密度分布图

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szw236

发布时间: 2020-7-27 10:38

正文摘要:

如图，xy彩色图显示了纳米管内水的密度，这是一篇文献的插图，这种图该如何去作？

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szw236 发表于 Post on 2020-7-30 11:16:28

换了gmx的版本，问题已解决

本帖最后由 szw236 于 2020-7-30 16:37 编辑

老师，我是在win10下运行的gromacs，在转eps文件时，运行命令后，没有文件生成，结果如下：

GROMACS:    gmx xpm2ps, version 2019.3
Executable: D:\gmx2019.3\bin\gmx.exe
Data prefix:  D:\gmx2019.3
Working dir:  E:\test\CNT_wat
Command line:
  gmx xpm2ps -f densmap.xpm -bx 5 -by 5 -rainbow blue
There is 1 matrix in densmap.xpm
Matrix 0 is 168 x 254

sobereva 发表于 Post on 2020-7-28 06:15:20

如果你是用GROMACS跑的，用gmx density直接就能得到

例如浸在水中的纳米管体系，垂直于纳米管方向的水的密度分布

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