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求助Gromacs的氢键判断标准和Ligplot+的不同点

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yogurt

发布时间: 2020-7-28 19:24

正文摘要:

本帖最后由 yogurt 于 2020-7-30 22:43 编辑请问老师，我找到了Gromacs的氢键判断标准是。还有后面的非键作用的参数有没有相应的论文，不知道这个参数是否适合我的蛋白质体系。谢谢

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liuyuje714 发表于 Post on 2020-7-29 08:48:12

本帖最后由 liuyuje714 于 2020-7-29 08:50 编辑

认真阅读原始文献J. Chem. Inf. Model. 2011, 51, 2778–2786，该文章引用的HBPLUS那篇文献J. Mol. Biol. 1994, 238, 777–793上面介绍的非常详细清楚怎么确定氢键。

sobereva 发表于 Post on 2020-7-28 22:34:11

根据中学的几何知识就能算出来

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