kexin 发表于 2022-5-9 12:03
您好！我遇到了类似的问题。我生成的mcpbpy.frcmod文件里键参数那有一部分为0，这说明没有生成相应的键参 ...

键参数为零，首先检查QM 优化是否正常结束。最好把log文件放出来，方便找错

chenjinfeng850 发表于 2020-8-26 12:10
跟金属原子相关的二面角为零是正常的。
MCPB.py的教程网页上有判断的标准（http://ambermd.org/tutorials/ ...

您好！我遇到了类似的问题。我生成的mcpbpy.frcmod文件里键参数那有一部分为0，这说明没有生成相应的键参数，请问一下该如何解决？非常感谢~

chenjinfeng850 发表于 2020-8-26 12:10
跟金属原子相关的二面角为零是正常的。
MCPB.py的教程网页上有判断的标准（http://ambermd.org/tutorials/ ...

原来如此，太谢谢了

跟金属原子相关的二面角为零是正常的。
MCPB.py的教程网页上有判断的标准（http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial20/mcpbpy.htm）
第三条写了
C) All or most of the dihedral potential barriers are zero for metal involved dihedrals;