本帖最后由 davi 于 2024-10-31 23:18 编辑 sobereva 发表于 2024-10-31 10:08 老师，对于2问题，我意思是是不需要将Li+与FSI-进行结构优化啥的吧，直接力场给出的电荷×0.8吧； 然后如果只考虑THF和2MeTHF作混溶溶剂的话，就是分别将一个设置为隐式溶剂模型去进行另一个的结构优化与resp电荷计算吗 还是文献的意思是 将Li+与FSI-离子先构建出来，采用SMD(设置THF与MeTHF混合隐式溶剂模型去优化，完了计算resp电荷呢)，那我计算出来还要×0.8吗，那对于THF和MeTHF就仅用结构优化完了算resp吗 |
davi 发表于 2024-10-31 21:35 1 是 2 D3是对整个体系所有原子而言的，没法只对某个部分加 没完整文章没法判断其它的 一个分子（不管自身是溶质还是溶剂分子）实际被什么溶剂包围，算这个分子用的隐式溶剂模型就得描述什么溶剂 |
本帖最后由 davi 于 2024-10-31 08:22 编辑 sobereva 发表于 2024-3-31 10:01 Sob老师，想要咨询一个问题，我研究LiFSI中Li+在THF(四氢呋喃)与2MeTHF(2甲基四氢呋喃)中的g(r)和配位，看文献的描述 1.Li+与FSI-离子是否直接用力场参数及电荷，然后考虑极化×0.8即可 2.下文提到的DFT+d3矫正是对溶剂分子嘛，后面不是要求设置SMD隐式溶剂模型，是将THF构建出来，2MeTHF做隐式溶剂这样去算THF的resp嘛，之后采用同样的方法去做2MeTHF的resp嘛 如果严格遵照文献是这样吗，老师。看您的隐士溶剂方面的博文，好像都是构建溶质分子，去将溶剂设置为隐式溶剂模型，感觉构建溶剂然后再设置溶剂没看到过。还是我对文献有误解呢，Sob老师 |
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DwyaneWan 发表于 2024-3-31 14:29 本来就是一种经验性很强的做法，不是该问为什么不普适，而是问凭什么能普适 |
sobereva 发表于 2020-9-10 03:19 sob老师，对于这种rescaling做法不普适有什么文章推荐吗？ 是不是会影响对一些目标构象的采样呢？ |
紫丹渡津 发表于 2020-9-10 10:15 谢谢  确实看到有不少文献中用了charge scaling，但还不明原理 |
sobereva 发表于 2020-9-10 03:19 谢谢Sob老师，我学习一下！ |
| 对于特定体系的某种性质的研究，rescaling是非常有必要的，比如对于离子液体transport properties的计算，rescaling已经算是通识了：见table 7. https://doi.org/10.1021/acs.jctc.7b00520 (以及这篇文章引用和被引的)。 |
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乘这种scale factor的做法不是什么被公认、普适的做法。如果你研究的体系和他文章里的类似，而且用的计算RESP电荷的级别完全一样，那么效仿还行，其它情况别轻易效仿。 什么时候做scale，和计算RESP电荷用的级别、溶剂环境有关。比如DFT结合像样基组在溶剂模型下直接算的RESP电荷，往往数值偏大（被溶剂场过极化），这时候scale一下有一点道理。 另外，按照下文的方式去算RESP2电荷，原理很理想，也不需要再做什么scale，避免了用scale带来的经验性。 RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算 http://sobereva.com/531（http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html） |
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