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谈谈Gaussian产生downhill路径的功能

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sobereva

发布时间: 2020-9-14 06:00

正文摘要:

谈谈Gaussian产生downhill路径的功能On the function of Gaussian program for generating downhill paths 文/Sobereva@北京科音 2020-Sep-14 1 前言在Gaussian程序的IRC关键词中，有一个叫dow ...

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wanan 发表于 Post on 2023-10-19 09:43:28

sobereva 发表于 2023-10-18 21:40
是

谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2023-10-18 21:40:23

wanan 发表于 2023-10-18 19:34
请问各位老师，用没有电场优化的结构，在电场下跑IRC(downhill)和直接在电场下优化得到的最终结果或结构是 ...

是

wanan 发表于 Post on 2023-10-18 19:34:27

请问各位老师，用没有电场优化的结构，在电场下跑IRC(downhill)和直接在电场下优化得到的最终结果或结构是不是相类似的？

星斗如盘 发表于 Post on 2022-5-27 15:00:18

sobereva 发表于 2022-1-5 10:36
你可以试试
需要恰当设置downhill任务产生的点的反应坐标的数值才有可能拼接

现在感觉这是一个很好续接IRC任务的方法。如果分子比较大，irc=calcall使用不起，只能使用irc=calcfc，有可能中间报错或者曲线不平滑，在需要的地方使用irc=downhill续算是个很好的选择

sobereva 发表于 Post on 2022-1-5 10:36:29

星斗如盘发表于 2022-1-5 10:04
因为IRC过程不稳定，经常报错，报错了就取最后一帧的结构进行downhill过程，downhill报错了，继续取最后 ...

你可以试试
需要恰当设置downhill任务产生的点的反应坐标的数值才有可能拼接

星斗如盘 发表于 Post on 2022-1-5 10:04:29

sobereva 发表于 2022-1-5 00:57
原理上得到的信息是相同的，但跑的步数和轨迹恰好相同那未必，里面还牵扯到算法数值细节，如Hessian矩阵 ...

因为IRC过程不稳定，经常报错，报错了就取最后一帧的结构进行downhill过程，downhill报错了，继续取最后一帧IRC，最后把所有的过程拼接起来，能不能当成一个完整的IRC过程呢？

sobereva 发表于 Post on 2022-1-5 00:57:18

星斗如盘发表于 2022-1-5 00:50
如果IRC步数比较少，取IRC过程的最后一帧结构做downhill，得到的结果和增加IRC步数得到的结果一样吗？

原理上得到的信息是相同的，但跑的步数和轨迹恰好相同那未必，里面还牵扯到算法数值细节，如Hessian矩阵的更新等

星斗如盘 发表于 Post on 2022-1-5 00:50:41

如果IRC步数比较少，取IRC过程的最后一帧结构做downhill，得到的结果和增加IRC步数得到的结果一样吗？

wzkchem5 发表于 Post on 2020-9-22 23:44:24

这个方法是不是对于无势垒的反应的VTST速率常数/隧穿校正计算比较有用？

sobereva 发表于 Post on 2020-9-22 22:57:30

15whyhq 发表于 2020-9-22 17:19
这个动态图是怎么做的？

gview直接保存的gif动画

喵星大佬 发表于 Post on 2020-9-22 17:35:21

15whyhq 发表于 2020-9-22 17:19
这个动态图是怎么做的？

GV播放动画然后用什么东西录一下

15whyhq 发表于 Post on 2020-9-22 17:19:26

这个动态图是怎么做的？

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