求助MS怎么改变原子编号

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发布时间: 2020-9-18 11:40

创建了苯乙烷单体（删去了氢原子），并且修改了每个碳的名字如图所示，但是再生成pdb文件时候碳原子的编号和我修改的名字不匹配怎么匹配起来呢？也就是说怎么修改原子的编号为C1=1 C2=2 C3=3 C4=4 C5=5 C6=6 C7=7 ...

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zwy123 发表于 Post on 2023-6-14 10:47:24

解决了吗，我也遇到这样的问题了

sobereva 发表于 Post on 2020-9-18 22:53:45

显然写脚本处理，怎么可能手动一个一个改

Sasuke 发表于 Post on 2020-9-18 18:54:52

Lacrimosa 发表于 2020-9-18 16:15
你直接修改pdb里的序号就可以了呀

嗯明白你意思这里只是临时举了个例子如果pdb文件包含很多原子的话比如说20个长度100的PS 有16000个原子坐标。。。手改的话太费时间了

Lacrimosa 发表于 Post on 2020-9-18 16:15:01

你直接修改pdb里的序号就可以了呀

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