求助，关于表面活性剂的mdp问题

查看数: 10625 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2020-9-19 09:33

卢老师，我根据培训班里纯水-真空体系的模拟计算，建了一个初始模型，真空-表面活性剂-水。但是跑完以后，盒子里的水往中间跑，卢老师，你看mdp文件里要添加些什么才能使水不往盒子中间跑，万分感谢，卢老师。

回复 Reply

明园 发表于 Post on 2020-9-20 13:55:51

sobereva 发表于 2020-9-20 07:37
trjconv结合-trans

好的谢谢卢老师

sobereva 发表于 Post on 2020-9-20 07:37:09

明园发表于 2020-9-19 14:21
卢老师，请问整个xtc轨迹文件，怎么整体往下调呢？好像editconf不能用xtc.

trjconv结合-trans

明园 发表于 Post on 2020-9-19 14:21:01

sobereva 发表于 2020-9-19 10:02
没有这种选项
你一开始的水太稀疏了，必然MD模拟后会收缩
想调整整体的位置用editconf加上translate

卢老师，请问整个xtc轨迹文件，怎么整体往下调呢？好像editconf不能用xtc.

明园 发表于 Post on 2020-9-19 10:03:14

sobereva 发表于 2020-9-19 10:02
没有这种选项
你一开始的水太稀疏了，必然MD模拟后会收缩
想调整整体的位置用editconf加上translate

好的谢谢卢老师

sobereva 发表于 Post on 2020-9-19 10:02:31

没有这种选项
你一开始的水太稀疏了，必然MD模拟后会收缩
想调整整体的位置用editconf加上translate

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register