lei234 发表于 2015-10-21 14:40
如何设置里面的变量是scan,我只固定过键长键角。。。

Gaussian说明书里写的很清楚

liyuanhe211 发表于 2015-10-21 13:14
opt=modredundant，里面变量是scan的话，就得到flexible PES，就是PES的每个点都经过优化。反之是Rigid P ...

如何设置里面的变量是scan,我只固定过键长键角。。。

lei234 发表于 2015-10-21 08:40
请问您说的flexible PES是什么东西，我怎么从网上没搜到。。是传说中的势能面吗？

opt=modredundant，里面变量是scan的话，就得到relaxed PES，就是PES的每个点都经过优化。反之是Rigid PES

liyuanhe211 发表于 2015-10-21 04:13
我个人认为这样可以基本认定没有过渡态了。

不要看着Gaussview说断键成键，GV显示出来的键级没什么意 ...

请问您说的flexible PES是什么东西，我怎么从网上没搜到。。是传说中的势能面吗？

sobereva 发表于 2015-10-21 01:21
1 这种情况很正常。当电子能量势垒很低，自由能垒往往会为负值。此时这就不算严格意义的过渡态了，真正的过 ...

有看到类似的帖子，但还是不确定，所以还是想请教一下，谢啦~

lei234 发表于 2015-10-20 20:54
1. IRC结束后得到的产物和反应物都有做opt freq=noraman,结构没有问题，图中的能量也是做完得到的。
2.  ...

我个人认为这样可以基本认定没有过渡态了。

不要看着Gaussview说断键成键，GV显示出来的键级没什么意义。

理论上你应该能通过relaxed PES扫描重复出你计算过渡态的结果（PES上键长就等于你优化出来TS键长的那一点应该是TS的能量和结构，且是这条曲线的极大值点）。

1 这种情况很正常。当电子能量势垒很低，自由能垒往往会为负值。此时这就不算严格意义的过渡态了，真正的过渡态是在自由能面上定义的，当前只是理论上的过渡态。论坛里以前也对此有过很多讨论。

2 如果右边那个分子得氢的意愿极为强烈，没有过渡态也是合理的。

个人想法：用IRC结束后反应物一端的结构做初始结构，走opt freq试试。

第二个问题：
以及什么叫“固定优化”？如果你说的是Rigid PES的话，扫Rigid PES（就一个键长变量）经常把有势垒的算成没势垒的（本来就是“断键”-“成键”才有过渡态，就一个键长变化那就成了一个键断裂了，可能就没有过渡态了）。至少把断裂的键和生成的键做一个二维的Rigid PES，不过我觉得这样可能还不如做一个opt=modredundant的relaxed PES了。

以及你过渡态都找到了，应该不用扫。

liyuanhe211 发表于 2015-10-20 19:35
图挂了？

图上传好了，可以帮我看看吗？

sobereva 发表于 2015-10-20 17:20
这样看图太累。怎么贴图在置顶的新人必读里都说明了，还是编辑一下主贴，把图片插入到合适的位置吧。

我重新编辑好了，可以再帮我看看吗？多谢~

liyuanhe211 发表于 2015-10-20 19:35
图挂了？

我在看新人怎么导图的...

图挂了？

这样看图太累。怎么贴图在置顶的新人必读里都说明了，还是编辑一下主贴，把图片插入到合适的位置吧。