拟合二面角参数时，二面角参数置零时扫出的势能线与DFT扫的势能线相差很大

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发布时间: 2020-10-9 22:37

我在拟合一个二面角时，二面角参数置零时扫出的势能线与DFT扫的势能线相差很大，DFT减去MM的曲线很难拟合，想请教我是哪里出了问题，我该如何拟合二面角。拟合的具体操作步骤： 1. 利用sob老师的gentor子程序产 ...

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ulosggs 发表于 Post on 2020-10-14 21:00:21

破晓时的曙光发表于 2020-10-13 19:12
MM做柔性扫描是MM对每个结构能量最小化吗？

固定二面角能量最小化

破晓时的曙光 发表于 Post on 2020-10-13 19:12:07

ulosggs 发表于 2020-10-13 19:08
DFT和MM都各自做柔性扫描。DFT的稳定构想和MM的稳定构想可能会有少许差别。你这张图中30度处的构象看起来有 ...

MM做柔性扫描是MM对每个结构能量最小化吗？

ulosggs 发表于 Post on 2020-10-13 19:08:48

DFT和MM都各自做柔性扫描。DFT的稳定构想和MM的稳定构想可能会有少许差别。你这张图中30度处的构象看起来有点问题。
再然后即便拟合不上也很正常。二面角势能面和1-4非键作用耦合很强。
要是都能拟合上，每年也不会有那么多的文章来改进已有力场的二面角参数了。

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