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求助如何解决力场文件无法识别原子的问题

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发布时间: 2020-10-12 22:58

正文摘要:

[url=][/url] 请问下要怎么解决这个问题,如果按照力场文件来调整修改受体文件里面原子类型,该把CG2修改成什么原子呢?

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Liota 发表于 Post on 2024-4-14 22:47:26
zhutuziqin 发表于 2021-11-5 11:40
您这个IUPAC具体规定的图片来源可以发一个网址吗

这个直接GOOGLE搜索就可以了
zhutuziqin 发表于 Post on 2021-11-5 11:40:00
snljty 发表于 2020-10-12 23:31
可以对照IUPAC的规定看一下。Pure & Appl. Chem., 70, 117(1998)
γ就是G。
应该是把结构文件中某个碳改 ...

您这个IUPAC具体规定的图片来源可以发一个网址吗
猴子好坏 发表于 Post on 2020-10-13 21:40:08
snljty 发表于 2020-10-12 23:31
可以对照IUPAC的规定看一下。Pure & Appl. Chem., 70, 117(1998)
γ就是G。
应该是把结构文件中某个碳改 ...

谢谢,按照您说的这个规则修改了,还是出现了同类型的错误
猴子好坏 发表于 Post on 2020-10-13 21:34:22
本帖最后由 猴子好坏 于 2020-10-13 21:35 编辑
DoubeeTwT 发表于 2020-10-13 08:55
Gama C找不到,检查一下是不是名字不叫CG2,THR上的某个C改过来就好

嗯嗯,改了之后原子错误的名字换成了被我修改的那个,然后也试了试对源文件拓扑也出现同样错误
DoubeeTwT 发表于 Post on 2020-10-13 08:55:24
Gama C找不到,检查一下是不是名字不叫CG2,THR上的某个C改过来就好
snljty 发表于 Post on 2020-10-12 23:31:43
可以对照IUPAC的规定看一下。Pure & Appl. Chem., 70, 117(1998)
γ就是G。
应该是把结构文件中某个碳改成CG2。

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