sophieding 发表于 2020-10-16 14:29 嗯,刚说错了,irc里有recalc,只是没有gdiis |
wzkchem5 发表于 2020-10-16 09:49 好的,感谢指教。IRC关键词写这个主要是过渡态优化也有这个,所以一起写上了,后来改为irc=(calcfc,recalc=5)已可运算。反应物的结构已进行了优化~ |
sophieding 发表于 2020-10-16 09:07 IRC后面不应该写(recalc=5,gdiis)。recalc和gdiis都是opt的专属选项,IRC没有这两个选项,所以报输入文件语法错误。 你优化了反应物结构吗?可能过渡态和反应物结构非常接近,或甚至即使在DFT水平下反应也是没有势垒的。 |
wzkchem5 发表于 2020-10-15 22:38 谢谢老师的指导。1.之前已经采用PM6对C5-C5进行了柔性扫描,得出的总能量曲线一直往下降。问过相关的老师,老师说可能是过渡态能垒比较低,导致能垒曲线一直往下降。查过相关文献,这个分子的类似物在断C5-C6的能垒时确实很低。 2.IRC输入文件已上传,望老师帮忙查看。 3.不好意思,之前写错了,应该是C3-O4。想做C3-O4均裂为两个自由基键解离能的能垒图,与C5-C6断键的做一个能垒图作为比较,探究哪个路径优先。 |
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1. 把初始结构的C5-C6缩短一些,再试。一般而言,如果过渡态优化收敛到类似产物的结构,那么把初猜结构往反应物方向变一变,反之则往产物方向变。如果仍然不行,可以对C5-C6键做一个relaxed scan,取最高点作为初猜结构。 2. 上传IRC文件的gjf,我们看看。L1就报错一般是因为关键词语法没写对。 3. 你指的是C3-O4吗?你会做C5-C6,那C3-O4也是同理啊 |
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