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IRC产物与反应物结构相同

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发布时间: 2015-10-30 10:15

正文摘要:

1.IRC得到的反应物和产物的结构一样,都跑到产物去了,请问是将stepsize调大还是调小,目前是10。 2. IRC得到的结构如图所示, ,请问这样的话过渡态有问题吗?可以说这两个结构是同一种东西吗?

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-10-8 17:06:00
wangxiaofeng 发表于 2022-10-7 09:42
老师,您的意思是固定优化的得到的结果只是优化极小点,不算是过度态吗?固定优化不是寻找过渡态的方法吗 ...

当然不是,你对找过渡态有关键性误区
Gaussian支持什么方式找过渡态看
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-10-7 09:42:30
sobereva 发表于 2022-10-6 20:15
你这是优化极小点任务,不是算过渡态任务
上传chk文件没有意义

老师,您的意思是固定优化的得到的结果只是优化极小点,不算是过度态吗?固定优化不是寻找过渡态的方法吗?
sobereva 发表于 Post on 2022-10-6 20:15:30
wangxiaofeng 发表于 2022-10-6 11:51
老师,您好!我也遇到了同样的情况做IRC两侧的结构相同,也尝试了手动左右拉Manual Displacement 保存结 ...

你这是优化极小点任务,不是算过渡态任务
上传chk文件没有意义
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-10-6 11:51:05
本帖最后由 wangxiaofeng 于 2022-10-6 15:55 编辑
sobereva 发表于 2015-10-30 16:28
不在于点数多少,关键都跑到尽量接近极小点。如果还没跑平坦说明还能继续跑。

这两种结构相差明显,特 ...

老师,您好!我也遇到了同样的情况做IRC两侧的结构相同,也尝试了手动左右拉Manual Displacement 保存结构去优化,发现优化出的结构也是一样的。结构已经上传了,请问是因为过渡态不对,还是别的原因?通过百度网盘分享的文件:TS.zip
链接:https://pan.baidu.com/s/15h_AyIwMt2G6aBINoScsDA
提取码:3e8t
复制这段内容打开「百度网盘APP 即可获取」

wyy015020 发表于 Post on 2019-1-14 19:35:07
hcxytpp@163.com 发表于 2015-10-31 08:33
我也遇到过好多次这样的情况,然后 是拿去重新找过渡态的

请问您是将过渡态的结构作为新的初猜结构,然后拿去重新优化吗?最后优化得到的过渡态结构和之前的结构差别大不大?
hcxytpp@163.com 发表于 Post on 2015-10-31 08:33:05
我也遇到过好多次这样的情况,然后 是拿去重新找过渡态的
sobereva 发表于 Post on 2015-10-31 05:39:50
lei234 发表于 2015-10-30 17:10
那您说的尽量跑长点儿翻译成关键字是指哪个?

就是指maxpoints设得很大,直到程序发现跑到了极小点才自动终止。但是跑得过程也应当注意时不时监控,看看跑到哪了。
lei234 发表于 Post on 2015-10-30 17:10:53
sobereva 发表于 2015-10-30 16:28
不在于点数多少,关键都跑到尽量接近极小点。如果还没跑平坦说明还能继续跑。

这两种结构相差明显,特 ...

那您说的尽量跑长点儿翻译成关键字是指哪个?
sobereva 发表于 Post on 2015-10-30 16:28:14
lei234 发表于 2015-10-30 15:25
可以说图中的两个结构是一样的吗?(本来也差不多啊,一个上面的分子是平的,一个竖起来而已)IRC尽量跑 ...

不在于点数多少,关键都跑到尽量接近极小点。如果还没跑平坦说明还能继续跑。

这两种结构相差明显,特别是氢键都完全不同
lei234 发表于 Post on 2015-10-30 15:25:31
sobereva 发表于 2015-10-30 11:24
1 过渡态搜索时opt=tight int=ultrafine,乃至用calcall,让过渡态定位准一些再跑IRC。还不行的话就把步长 ...

可以说图中的两个结构是一样的吗?(本来也差不多啊,一个上面的分子是平的,一个竖起来而已)IRC尽量跑长的意思是maxpoint设置大一点儿吗,现在已经是100了。。。
sobereva 发表于 Post on 2015-10-30 11:24:24
1 过渡态搜索时opt=tight int=ultrafine,乃至用calcall,让过渡态定位准一些再跑IRC。还不行的话就把步长加大,默认是10,可以尝试20甚至30。

2 不知道你的IRC跑成了什么程度。如果IRC曲线最后还没平坦,应该IRC尽量跑长,再拿末尾的结构继续优化。而且优化的时候为稳妥建议用较小的步长上限(如maxstep=5,notrust),免得一优化,一下子穿越小势垒跑到其它极小点去。

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