wangxiaofeng 发表于 2022-10-7 09:42 当然不是,你对找过渡态有关键性误区 Gaussian支持什么方式找过渡态看 简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3 http://sobereva.com/460(http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html) |
sobereva 发表于 2022-10-6 20:15 老师,您的意思是固定优化的得到的结果只是优化极小点,不算是过度态吗?固定优化不是寻找过渡态的方法吗? |
wangxiaofeng 发表于 2022-10-6 11:51 你这是优化极小点任务,不是算过渡态任务 上传chk文件没有意义 |
本帖最后由 wangxiaofeng 于 2022-10-6 15:55 编辑 sobereva 发表于 2015-10-30 16:28 老师,您好!我也遇到了同样的情况做IRC两侧的结构相同,也尝试了手动左右拉Manual Displacement 保存结构去优化,发现优化出的结构也是一样的。结构已经上传了,请问是因为过渡态不对,还是别的原因?通过百度网盘分享的文件:TS.zip 链接:https://pan.baidu.com/s/15h_AyIwMt2G6aBINoScsDA 提取码:3e8t 复制这段内容打开「百度网盘APP 即可获取」 |
hcxytpp@163.com 发表于 2015-10-31 08:33 请问您是将过渡态的结构作为新的初猜结构,然后拿去重新优化吗?最后优化得到的过渡态结构和之前的结构差别大不大? |
我也遇到过好多次这样的情况,然后 是拿去重新找过渡态的![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
lei234 发表于 2015-10-30 17:10 就是指maxpoints设得很大,直到程序发现跑到了极小点才自动终止。但是跑得过程也应当注意时不时监控,看看跑到哪了。 |
sobereva 发表于 2015-10-30 16:28 那您说的尽量跑长点儿翻译成关键字是指哪个? |
lei234 发表于 2015-10-30 15:25 不在于点数多少,关键都跑到尽量接近极小点。如果还没跑平坦说明还能继续跑。 这两种结构相差明显,特别是氢键都完全不同 |
sobereva 发表于 2015-10-30 11:24 可以说图中的两个结构是一样的吗?(本来也差不多啊,一个上面的分子是平的,一个竖起来而已)IRC尽量跑长的意思是maxpoint设置大一点儿吗,现在已经是100了。。。 |
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1 过渡态搜索时opt=tight int=ultrafine,乃至用calcall,让过渡态定位准一些再跑IRC。还不行的话就把步长加大,默认是10,可以尝试20甚至30。 2 不知道你的IRC跑成了什么程度。如果IRC曲线最后还没平坦,应该IRC尽量跑长,再拿末尾的结构继续优化。而且优化的时候为稳妥建议用较小的步长上限(如maxstep=5,notrust),免得一优化,一下子穿越小势垒跑到其它极小点去。 |
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