DMC的极性很弱，在水中溶解度不可能是139g/L。感觉数据来源有误

k64_cc 发表于 2020-10-30 16:52
你做个大点的盒子，构建的时候就构建成有明确分层的状态，然后再看。

现在的盒子看起来不是很清晰，最好 ...

非常感谢

c00jsw00 发表于 2020-10-30 20:48
1. box 太小
2.gaff 畢竟是通用參數..改使用比較專門的吧

谢谢您

Graphite 发表于 2020-10-30 21:43
0、139 g/L算易溶物吧。
1、做溶解模拟对力场要求很高，得多试。加入锂盐的话就更复杂了，锂对有机物，阴 ...

非常感谢您

0、139 g/L算易溶物吧。
1、做溶解模拟对力场要求很高，得多试。加入锂盐的话就更复杂了，锂对有机物，阴离子对有机物的非键参数可能没有。
2、看样子部分溶了，但一般模拟溶解动态过程需要很长时间；而且盒子小了，有机物在周期上聚集明显。
3、什么水模型可能没那么重要，但是水的电荷和处理非键作用的方式影响很大。

1. box 太小
2.gaff 畢竟是通用參數..改使用比較專門的吧

你做个大点的盒子，构建的时候就构建成有明确分层的状态，然后再看。

现在的盒子看起来不是很清晰，最好做成A x A x 2A的尺寸，然后在较长的维度放两个slab。水大概放1000个，有机物放相等体积的，然后再跑。

碳酸二甲酯的溶解度，按你的数据大概1.5mol/L，水分子和有机物比例~35：1。完全不溶应该不至于吧。

Aristotler 发表于 2020-10-30 16:23
嗯嗯，谢谢。我现在都是在900个水中加入300个有机分子，计算结果是如上面说的，这样的方式是不是溶解度少 ...

目前这样的结果难以和溶解度联系起来吧？你可以先把300个有机分子900个水化成g/L的形式再进行比较，

Lacrimosa 发表于 2020-10-30 15:58
首先确定一下有机物和水的比例是不是按照溶解度来加入的。通过分层来判断溶解度或许不太严谨，例如280g/L ...

嗯嗯，谢谢。我现在都是在900个水中加入300个有机分子，计算结果是如上面说的，这样的方式是不是溶解度少的会团聚的更明显一些？但是结果却相反 求教

Aristotler 发表于 2020-10-30 15:45
感谢你的回复，我这边还计算了另一种有机物和水的溶解性，那个有机物在水中的溶解度是280g/L, 但是那个有 ...

首先确定一下有机物和水的比例是不是按照溶解度来加入的。通过分层来判断溶解度或许不太严谨，例如280g/L和139g/L，同样的盒子体积下，显然是280g/L中的有机物更多一些，那样分层自然明显。另外盒子的形状不同或许也会有影响，如果是长方体的盒子或许就会有明显的分层现象，正方体盒子中或许就只是聚成一团

Lacrimosa 发表于 2020-10-30 15:42
从模拟的图中看DMC已经聚集在一起了，并没有溶在水里吧

感谢你的回复，我这边还计算了另一种有机物和水的溶解性，那个有机物在水中的溶解度是280g/L, 但是那个有机分子的计算结构是非常明显的看到了油水分层，要比DMC和H2O的更加明显，但DMC的溶解性更低（139g/L）。有些迷惑，还请赐教

从模拟的图中看DMC已经聚集在一起了，并没有溶在水里吧