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求助:模拟离子在通道的传输过程中,经过nvt模拟后水分子分布不均匀

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发布时间: 2020-11-6 10:54

正文摘要:

我想模拟离子在纳米通道中传输的体系,溶剂是水。我把纳米材料固定住,先跑了能量最小化后,直接跑nvt模拟。用的是恒定的298K的温度。为什么nvt跑了几十纳秒后水分子仍然分布很不均匀?我跑了30ns,感觉时间应该是足 ...

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sobereva 发表于 Post on 2020-11-15 09:17:40
这个图上看不清楚纳米通道的结构,也不知道灰球是什么,也不知道右边的真空区是怎么回事。这个结构看起来很奇怪

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