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UFF力场下小分子断裂问题求助

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发布时间: 2020-11-15 23:12

正文摘要:

在真空中使用UFF力场进行模拟没有显著问题,放入甲苯中(甲苯与有机小分子都使用UFF力场)进行能量最小化后小分子断裂了这是怎么回事,该怎么解决。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2020-11-17 02:21:19
孙宝刚 发表于 2020-11-16 22:24
老师拓扑文件是UFF网站自动生成的,这个哪里会出问题呢。而且20个有机小分子有些断裂有些还是好的。请老 ...

自行检查[bonds]项,看看有没有漏的
孙宝刚 发表于 Post on 2020-11-16 22:24:18
本帖最后由 孙宝刚 于 2020-11-16 22:26 编辑
sobereva 发表于 2020-11-15 23:22
只可能是拓扑文件有问题,仔细反复检查

老师拓扑文件是UFF网站自动生成的,这个哪里会出问题呢。而且20个有机小分子有些断裂有些还是好的。请老师指点。
sobereva 发表于 Post on 2020-11-15 23:22:31
只可能是拓扑文件有问题,仔细反复检查

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