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有没有简单易行的方法,快速将itp里面的电荷替换为RESP电荷

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发布时间: 2020-11-18 13:29

正文摘要:

本帖最后由 牧生 于 2020-11-18 13:40 编辑 分子式为CTAB阳离子结构部分 ①   使用懒人脚本计算了CTAB的resp电荷,如附件中CTAB.chg 我只能一个原子一个原子的去找了,进行了替换。 如果 ...

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牧生 发表于 Post on 2020-11-18 16:46:14
liuyuje714 发表于 2020-11-18 13:54
胡说,itp和最开始的pdb是对应的,只不过你的chg顺序有问题。很明显gaussian读的pdb和用acpype的不是同一个 ...

感谢感谢。。

这次对了。
liuyuje714 发表于 Post on 2020-11-18 13:54:26
本帖最后由 liuyuje714 于 2020-11-18 14:22 编辑

胡说,itp和最开始的pdb是对应的,只不过你的chg顺序有问题。很明显gaussian读的pdb和用acpype的不是同一个文件,不然顺序不可能会变

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